31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_0678 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_0678  DNA polymerase beta domain protein region  100 
 
 		 114 aa  233  5.0000000000000005e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000111019  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4035  DNA polymerase beta domain protein region  46.02 
 
 		 113 aa  112  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4052  hypothetical protein  45.76 
 
 		 59 aa  60.8  0.000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4164  DNA polymerase beta domain protein region  35.96 
 
 		 113 aa  55.8  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1565  DNA polymerase, beta-like region  28.7 
 
 		 111 aa  52.8  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.318501 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0500  DNA polymerase beta subunit  28.87 
 
 		 110 aa  52  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000767476  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0399  DNA polymerase beta subunit  29.79 
 
 		 155 aa  48.5  0.00003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0317  DNA polymerase beta domain protein region  45.45 
 
 		 121 aa  48.5  0.00003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1643  DNA polymerase beta domain protein region  29.91 
 
 		 115 aa  46.2  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0524  DNA polymerase beta subunit  30.3 
 
 		 113 aa  45.8  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2919  DNA polymerase beta domain protein region  56.25 
 
 		 173 aa  45.1  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0596  DNA polymerase beta domain protein region  33 
 
 		 174 aa  44.7  0.0004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0115055  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2316  DNA polymerase beta domain protein region  47.37 
 
 		 155 aa  43.9  0.0007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.763015  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2347  DNA polymerase beta subunit  48.78 
 
 		 116 aa  43.1  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.048778  normal  0.250853 
 
 
-
 
NC_013167  Cyan8802_4607  DNA polymerase beta domain protein region  28.33 
 
 		 119 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1277  DNA polymerase beta subunit  22.77 
 
 		 111 aa  43.5  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1200  DNA polymerase beta subunit  29.09 
 
 		 111 aa  43.5  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.504672  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3917  hypothetical protein  43.75 
 
 		 230 aa  42  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.038879 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0203  DNA polymerase beta subunit  30.34 
 
 		 155 aa  41.6  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2571  DNA polymerase beta domain protein region  28.7 
 
 		 126 aa  42  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.373399  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2850  DNA polymerase beta domain protein region  53.85 
 
 		 111 aa  41.6  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.787876  normal  0.338784 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0988  DNA polymerase beta subunit  33.33 
 
 		 112 aa  41.2  0.004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0677901 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1397  DNA polymerase beta subunit  26 
 
 		 171 aa  41.6  0.004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0515  DNA polymerase beta domain protein region  27.71 
 
 		 108 aa  41.2  0.005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0793119  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3041  DNA polymerase beta subunit  25 
 
 		 116 aa  40.8  0.006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1270  metal dependent phosphohydrolase  33.9 
 
 		 897 aa  40.8  0.007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.439382 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0018  DNA polymerase beta domain protein region  40.38 
 
 		 117 aa  40.4  0.007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.21199  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5631  DNA polymerase beta domain protein region  36.63 
 
 		 102 aa  40.4  0.007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000350885  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0064  hypothetical protein  41.3 
 
 		 94 aa  40.4  0.008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.262773  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1450  DNA polymerase beta subunit  32.38 
 
 		 115 aa  40.4  0.009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.374866 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1920  DNA polymerase beta subunit  30.34 
 
 		 116 aa  40  0.01  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000388354 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>