14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tneu_0988 on replicon NC_010525
Organism: Thermoproteus neutrophilus V24Sta



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010525  Tneu_0988  DNA polymerase beta subunit  100 
 
 
112 aa  219  9.999999999999999e-57  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0677901 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0064  hypothetical protein  77.46 
 
 
94 aa  102  2e-21  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.262773  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1596  hypothetical protein  70.59 
 
 
69 aa  99  2e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0317  DNA polymerase beta domain protein region  35.44 
 
 
121 aa  51.6  0.000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1812  DNA polymerase beta subunit  36.26 
 
 
106 aa  48.1  0.00004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0323  DNA polymerase beta subunit  36.71 
 
 
116 aa  48.1  0.00004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.103671  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2571  DNA polymerase beta domain protein region  40.98 
 
 
126 aa  47.8  0.00005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.373399  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0304  DNA polymerase beta subunit  36.71 
 
 
116 aa  47.4  0.00007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4420  DNA polymerase beta subunit  36.67 
 
 
118 aa  44.3  0.0006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.478946  normal  0.142305 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1686  DNA polymerase beta subunit  36.46 
 
 
121 aa  42  0.003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.0000153026  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2641  DNA polymerase beta domain protein region  37.5 
 
 
125 aa  41.6  0.004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0500  DNA polymerase beta domain protein region  36.78 
 
 
135 aa  41.6  0.004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0678  DNA polymerase beta domain protein region  33.33 
 
 
114 aa  41.2  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000111019  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4035  DNA polymerase beta domain protein region  33.73 
 
 
113 aa  40.8  0.007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>