20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_0304 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009486  Tpet_0304  DNA polymerase beta subunit  100 
 
 		 116 aa  231  3e-60  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0323  DNA polymerase beta subunit  91.38 
 
 		 116 aa  209  1e-53  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.103671  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0320  hypothetical protein  86 
 
 		 260 aa  91.7  3e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000112261  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0988  DNA polymerase beta subunit  36.71 
 
 		 112 aa  47.4  0.00007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0677901 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0686  DNA polymerase beta subunit  45.1 
 
 		 96 aa  47  0.0001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0225  DNA polymerase beta domain protein region  37.25 
 
 		 142 aa  46.6  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1044  DNA polymerase beta subunit  35.56 
 
 		 122 aa  45.1  0.0003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2191  DNA polymerase beta subunit  31.76 
 
 		 111 aa  45.4  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.190588  normal  0.488652 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1617  DNA polymerase beta domain-containing protein region  37.23 
 
 		 103 aa  44.7  0.0005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.450393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0576  DNA polymerase beta subunit  33.78 
 
 		 121 aa  42.4  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.887062  normal  0.28507 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2571  DNA polymerase beta domain protein region  29.31 
 
 		 126 aa  42.7  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.373399  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1691  DNA polymerase beta subunit  40 
 
 		 130 aa  42.4  0.002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.0000100624  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4127  hypothetical protein  35.79 
 
 		 191 aa  42  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000129079 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0897  DNA polymerase beta subunit  33.72 
 
 		 123 aa  41.2  0.004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0603  hypothetical protein  30 
 
 		 104 aa  41.6  0.004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1064  hypothetical protein  40.43 
 
 		 53 aa  41.2  0.005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.162255  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2214  hypothetical protein  36.73 
 
 		 63 aa  41.2  0.005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0275892  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0793  DNA polymerase, beta-like region  40.48 
 
 		 110 aa  40.4  0.008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.304754 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1655  DNA polymerase beta domain protein region  29.46 
 
 		 128 aa  40.4  0.008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0574  DNA polymerase beta subunit  30 
 
 		 120 aa  40  0.01  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.412375  normal  0.178688 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>