46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_0793 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_0793  DNA polymerase, beta-like region  100 
 
 		 110 aa  218  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.304754 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4901  DNA polymerase, beta-like region  67.27 
 
 		 118 aa  130  6e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.974708 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3303  DNA polymerase beta domain protein region  33.03 
 
 		 114 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.433068 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0354  DNA polymerase beta subunit  32.67 
 
 		 105 aa  53.5  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3842  DNA polymerase beta subunit  32.99 
 
 		 127 aa  50.8  0.000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000823006 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1617  DNA polymerase beta domain-containing protein region  30.93 
 
 		 103 aa  50.4  0.000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.450393  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1681  DNA polymerase, beta-like region  30.69 
 
 		 107 aa  49.7  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.044025  normal  1 
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0037  nucleotidyltransferase domain-containing protein  30 
 
 		 132 aa  49.7  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0104  DNA polymerase beta domain protein region  30.23 
 
 		 114 aa  49.3  0.00002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0040  nucleotidyltransferase domain protein  30 
 
 		 128 aa  48.9  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000549944 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0063  nucleotidyltransferase domain protein  30 
 
 		 128 aa  48.9  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0102  nucleotidyltransferase domain-containing protein  30 
 
 		 128 aa  48.9  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0913883  n/a   
 
 
-
 
NC_011774  BCG9842_A0076  nucleotidyltransferase domain protein  30.34 
 
 		 110 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.467951  normal  0.54284 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2470  DNA polymerase beta subunit  35.16 
 
 		 105 aa  48.1  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.22963  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0365  DNA polymerase beta subunit  47.27 
 
 		 113 aa  47  0.00008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.200117 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2147  DNA polymerase beta domain protein region  32.35 
 
 		 112 aa  47  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5202  DNA polymerase beta domain protein region  40.3 
 
 		 152 aa  46.2  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.430498 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1619  DNA polymerase beta domain-containing protein region  25.25 
 
 		 105 aa  46.6  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.316623  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3041  DNA polymerase beta subunit  52.27 
 
 		 116 aa  45.4  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1987  DNA polymerase beta domain protein region  38.82 
 
 		 274 aa  44.3  0.0005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0203  DNA polymerase beta subunit  28.07 
 
 		 155 aa  44.7  0.0005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2718  DNA polymerase, beta-like region  44.19 
 
 		 109 aa  43.9  0.0008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000888869  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2490  DNA polymerase beta domain protein region  26.42 
 
 		 110 aa  43.9  0.0008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3233  nucleotidyltransferase domain protein  29.36 
 
 		 166 aa  43.9  0.0008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.73519  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2669  DNA polymerase beta domain protein region  25.51 
 
 		 110 aa  43.5  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3225  nucleotidyltransferase domain-containing protein  29.36 
 
 		 166 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00907014  n/a   
 
 
-
 
NC_006663  SEA0015  hypothetical protein  41.86 
 
 		 289 aa  42.7  0.002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1405  hypothetical protein  30.77 
 
 		 117 aa  42.7  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.11002 
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4484  DNA polymerase beta domain protein region  29.7 
 
 		 146 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0317  DNA polymerase beta domain protein region  27.78 
 
 		 121 aa  42.4  0.002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0399  DNA polymerase beta subunit  30.34 
 
 		 155 aa  42.7  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1920  DNA polymerase beta subunit  54.76 
 
 		 116 aa  42.4  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000388354 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0236  DNA polymerase beta subunit  30.77 
 
 		 103 aa  42  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0347  DNA polymerase beta domain protein region  43.75 
 
 		 102 aa  42  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1320  DNA polymerase beta subunit  40.32 
 
 		 137 aa  41.2  0.004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.475196  normal  0.327189 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3962  DNA polymerase beta domain protein region  32.98 
 
 		 105 aa  41.2  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2919  DNA polymerase beta domain protein region  50 
 
 		 173 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0295  DNA polymerase beta domain protein region  30.95 
 
 		 98 aa  41.2  0.005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7419  hypothetical protein  44 
 
 		 280 aa  41.2  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0574  DNA polymerase beta subunit  51.16 
 
 		 120 aa  41.2  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.412375  normal  0.178688 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0323  DNA polymerase beta subunit  40.91 
 
 		 116 aa  40.8  0.006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.103671  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0284  DNA polymerase beta domain protein region  30.95 
 
 		 99 aa  40.8  0.006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0576  DNA polymerase beta subunit  48.84 
 
 		 121 aa  40.8  0.007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.887062  normal  0.28507 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1397  DNA polymerase, beta-like region  62.07 
 
 		 113 aa  40.4  0.008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0304  DNA polymerase beta subunit  40.48 
 
 		 116 aa  40.4  0.008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1347  DNA polymerase beta subunit  51.11 
 
 		 125 aa  40  0.01  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.103374  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>