15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_1347 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_1347  DNA polymerase beta subunit  100 
 
 		 125 aa  257  4e-68  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.103374  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0463  DNA polymerase beta subunit  48.36 
 
 		 127 aa  124  4.0000000000000003e-28  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1089  DNA polymerase beta subunit  43.7 
 
 		 127 aa  111  4.0000000000000004e-24  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.947057 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0821  DNA polymerase beta subunit  38.79 
 
 		 140 aa  77  0.00000000000008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.29047 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1502  DNA polymerase beta subunit  37.17 
 
 		 214 aa  62.8  0.000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000371654 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0587  DNA polymerase beta subunit  36.73 
 
 		 120 aa  60.8  0.000000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.838533 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1320  DNA polymerase beta subunit  31.4 
 
 		 137 aa  60.1  0.00000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.475196  normal  0.327189 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1691  DNA polymerase beta subunit  33.04 
 
 		 130 aa  46.2  0.0001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.0000100624  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3303  DNA polymerase beta domain protein region  55.1 
 
 		 114 aa  41.2  0.005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.433068 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4901  DNA polymerase, beta-like region  63.64 
 
 		 118 aa  40.8  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.974708 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3917  hypothetical protein  53.12 
 
 		 230 aa  40.8  0.006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.038879 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1920  DNA polymerase beta subunit  48.84 
 
 		 116 aa  40.4  0.007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000388354 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4035  DNA polymerase beta domain protein region  44.19 
 
 		 113 aa  40.4  0.008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0793  DNA polymerase, beta-like region  51.11 
 
 		 110 aa  40  0.01  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.304754 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1699  hypothetical protein  47.5 
 
 		 61 aa  40  0.01  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.329648 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>