27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_4035 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013216  Dtox_4035  DNA polymerase beta domain protein region  100 
 
 
113 aa  231  3e-60  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0678  DNA polymerase beta domain protein region  46.02 
 
 
114 aa  112  2.0000000000000002e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000111019  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4052  hypothetical protein  89.83 
 
 
59 aa  105  2e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4053  hypothetical protein  94.44 
 
 
41 aa  73.6  0.000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0524  DNA polymerase beta subunit  40 
 
 
113 aa  48.9  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0500  DNA polymerase beta subunit  29.7 
 
 
110 aa  47  0.00008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000767476  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0104  DNA polymerase beta domain protein region  37.97 
 
 
114 aa  47  0.00009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1277  DNA polymerase beta subunit  29.17 
 
 
111 aa  47  0.00009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4164  DNA polymerase beta domain protein region  28.32 
 
 
113 aa  46.2  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0399  DNA polymerase beta subunit  28.57 
 
 
155 aa  46.2  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3303  DNA polymerase beta domain protein region  27.45 
 
 
114 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.433068 
 
 
-
 
NC_013167  Cyan8802_4607  DNA polymerase beta domain protein region  27.88 
 
 
119 aa  45.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4420  DNA polymerase beta subunit  29.13 
 
 
118 aa  45.1  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.478946  normal  0.142305 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1565  DNA polymerase, beta-like region  26.53 
 
 
111 aa  44.7  0.0004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.318501 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3041  DNA polymerase beta subunit  27.45 
 
 
116 aa  44.7  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1920  DNA polymerase beta subunit  28.74 
 
 
116 aa  44.3  0.0006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000388354 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0203  DNA polymerase beta subunit  31.11 
 
 
155 aa  43.1  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2718  DNA polymerase, beta-like region  33.33 
 
 
109 aa  43.1  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000888869  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2209  DNA polymerase beta domain protein region  52.63 
 
 
113 aa  42.4  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0463  DNA polymerase beta subunit  65.38 
 
 
127 aa  41.6  0.004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1397  DNA polymerase beta subunit  30.14 
 
 
171 aa  41.6  0.004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0317  DNA polymerase beta domain protein region  28.09 
 
 
121 aa  41.2  0.005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0988  DNA polymerase beta subunit  33.73 
 
 
112 aa  40.8  0.007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0677901 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3539  DNA polymerase, beta-like region  38.1 
 
 
104 aa  40.8  0.007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.418484  normal  0.469828 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0500  DNA polymerase beta domain protein region  30.1 
 
 
135 aa  40.8  0.007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1347  DNA polymerase beta subunit  44.19 
 
 
125 aa  40.4  0.008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.103374  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4901  DNA polymerase, beta-like region  55.17 
 
 
118 aa  40.4  0.008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.974708 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>