19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_0500 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_0500  DNA polymerase beta subunit  100 
 
 		 110 aa  220  6e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000767476  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1565  DNA polymerase, beta-like region  43.27 
 
 		 111 aa  107  7.000000000000001e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.318501 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0524  DNA polymerase beta subunit  36.45 
 
 		 113 aa  100  9e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0678  DNA polymerase beta domain protein region  28.87 
 
 		 114 aa  52  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000111019  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4035  DNA polymerase beta domain protein region  29.7 
 
 		 113 aa  47  0.00008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2919  DNA polymerase beta domain protein region  31.87 
 
 		 173 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0218  DNA polymerase beta subunit  55 
 
 		 110 aa  44.3  0.0006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0086  DNA polymerase beta subunit  30.49 
 
 		 100 aa  43.5  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.109385  normal  0.256886 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0844  DNA polymerase beta subunit  45.45 
 
 		 116 aa  43.1  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.909458  normal  0.0926269 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4420  DNA polymerase beta subunit  28.85 
 
 		 118 aa  43.1  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.478946  normal  0.142305 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2316  DNA polymerase beta domain protein region  39.73 
 
 		 155 aa  42.7  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.763015  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0018  DNA polymerase beta domain protein region  28.3 
 
 		 117 aa  42.4  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.21199  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0515  DNA polymerase beta domain protein region  35.82 
 
 		 108 aa  42.4  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0793119  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5631  DNA polymerase beta domain protein region  29.7 
 
 		 102 aa  42  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000350885  normal  1 
 
 
-
 
NC_013167  Cyan8802_4607  DNA polymerase beta domain protein region  31.82 
 
 		 119 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5246  DNA polymerase beta domain protein region  32.23 
 
 		 284 aa  42  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.93784  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5202  DNA polymerase beta domain protein region  29 
 
 		 152 aa  42  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.430498 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3070  DNA polymerase, beta-like region  30.26 
 
 		 116 aa  40.8  0.007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.531751 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3917  hypothetical protein  31.43 
 
 		 230 aa  40.4  0.008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.038879 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>