12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_5202 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_5202  DNA polymerase beta domain protein region  100 
 
 		 152 aa  307  4e-83  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.430498 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5274  hypothetical protein  57.78 
 
 		 119 aa  100  8e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0399  DNA polymerase beta subunit  47.37 
 
 		 155 aa  98.2  3e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0203  DNA polymerase beta subunit  47.67 
 
 		 155 aa  89  2e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4735  DNA polymerase beta subunit  58.21 
 
 		 89 aa  73.6  0.000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0793  DNA polymerase, beta-like region  40.3 
 
 		 110 aa  46.2  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.304754 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0524  DNA polymerase beta subunit  31.4 
 
 		 113 aa  45.4  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4901  DNA polymerase, beta-like region  65.52 
 
 		 118 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.974708 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1643  DNA polymerase beta domain protein region  28.89 
 
 		 115 aa  42.4  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1405  hypothetical protein  26.88 
 
 		 117 aa  42  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.11002 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0500  DNA polymerase beta subunit  29 
 
 		 110 aa  42  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000767476  n/a   
 
 
-
 
NC_011774  BCG9842_A0076  nucleotidyltransferase domain protein  38.78 
 
 		 110 aa  41.2  0.006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.467951  normal  0.54284 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>