23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_5631 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_5631  DNA polymerase beta domain protein region  100 
 
 
102 aa  213  5e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000350885  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3436  DNA polymerase beta subunit  41.54 
 
 
107 aa  52  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.212553 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1617  DNA polymerase beta domain-containing protein region  37.14 
 
 
103 aa  49.7  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.450393  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0018  DNA polymerase beta domain protein region  40.21 
 
 
117 aa  49.3  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.21199  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0718  DNA polymerase beta subunit  53.66 
 
 
112 aa  47.8  0.00005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.525185 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0489  DNA polymerase beta subunit  50 
 
 
111 aa  46.6  0.0001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0524  DNA polymerase beta subunit  32.65 
 
 
113 aa  46.2  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1397  DNA polymerase, beta-like region  51.16 
 
 
113 aa  45.1  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1619  DNA polymerase beta domain-containing protein region  42.86 
 
 
105 aa  43.9  0.0008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.316623  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3303  DNA polymerase beta domain protein region  75 
 
 
114 aa  43.9  0.0008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.433068 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2718  DNA polymerase, beta-like region  36.36 
 
 
109 aa  43.9  0.0008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000888869  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3041  DNA polymerase beta subunit  44.26 
 
 
116 aa  43.1  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0463  DNA polymerase beta subunit  50 
 
 
127 aa  43.1  0.001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00100  nucleotidyltransferase family protein  39.71 
 
 
255 aa  43.5  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.994546  normal  0.283746 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1089  DNA polymerase beta subunit  60.53 
 
 
127 aa  42.7  0.002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.947057 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1920  DNA polymerase beta subunit  35.71 
 
 
116 aa  42.7  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000388354 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0500  DNA polymerase beta subunit  29.7 
 
 
110 aa  42  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000767476  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2209  DNA polymerase beta domain protein region  40.48 
 
 
113 aa  41.6  0.003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4035  DNA polymerase beta subunit  46.51 
 
 
103 aa  40.8  0.006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3505  DNA polymerase beta subunit  53.12 
 
 
115 aa  40.8  0.007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2611  DNA polymerase beta domain protein region  35.59 
 
 
94 aa  40.8  0.007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2432  DNA polymerase beta subunit  35.19 
 
 
111 aa  40.8  0.007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.71469  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0678  DNA polymerase beta domain protein region  36.63 
 
 
114 aa  40.4  0.008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000111019  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>