24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_2919 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_2919  DNA polymerase beta domain protein region  100 
 
 
173 aa  348  2e-95  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0018  DNA polymerase beta domain protein region  43.48 
 
 
117 aa  65.9  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.21199  normal 
 
 
-
 
NC_013167  Cyan8802_4607  DNA polymerase beta domain protein region  38.37 
 
 
119 aa  63.2  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2850  DNA polymerase beta domain protein region  41.38 
 
 
111 aa  58.9  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.787876  normal  0.338784 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3349  hypothetical protein  43.04 
 
 
111 aa  54.7  0.0000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0046  hypothetical protein  43.64 
 
 
70 aa  48.1  0.00006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2718  DNA polymerase, beta-like region  39.39 
 
 
109 aa  47.8  0.00007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000888869  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1643  DNA polymerase beta domain protein region  31.25 
 
 
115 aa  46.6  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0399  DNA polymerase beta subunit  32.63 
 
 
155 aa  46.2  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0500  DNA polymerase beta subunit  31.87 
 
 
110 aa  45.8  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000767476  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1565  DNA polymerase, beta-like region  38.2 
 
 
111 aa  45.4  0.0004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.318501 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2316  DNA polymerase beta domain protein region  43.4 
 
 
155 aa  45.1  0.0005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.763015  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3436  DNA polymerase beta subunit  33.82 
 
 
107 aa  44.7  0.0006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.212553 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0678  DNA polymerase beta domain protein region  56.25 
 
 
114 aa  45.1  0.0006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000111019  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0203  DNA polymerase beta subunit  29.89 
 
 
155 aa  44.3  0.0008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0317  DNA polymerase beta domain protein region  36.54 
 
 
121 aa  43.1  0.002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0251  DNA polymerase beta subunit  35.71 
 
 
110 aa  42.4  0.003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0736042  normal  0.344396 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0524  DNA polymerase beta subunit  36.26 
 
 
113 aa  42.4  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4164  DNA polymerase beta domain protein region  35.16 
 
 
113 aa  42.4  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1397  DNA polymerase, beta-like region  54.76 
 
 
113 aa  42.7  0.003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0596  DNA polymerase beta domain protein region  36.56 
 
 
174 aa  42.4  0.004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0115055  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3130  DNA polymerase beta subunit  37.68 
 
 
265 aa  41.6  0.005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.228068  normal  0.554977 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1687  DNA polymerase beta subunit  30.47 
 
 
205 aa  41.6  0.006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0793  DNA polymerase, beta-like region  50 
 
 
110 aa  41.2  0.007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.304754 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>