12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_3130 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_3130  DNA polymerase beta subunit  100 
 
 		 265 aa  540  1e-153  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.228068  normal  0.554977 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3933  hypothetical protein  48.39 
 
 		 264 aa  212  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0148216  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46260  hypothetical protein  45.53 
 
 		 252 aa  187  2e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.231061  normal  0.0695784 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2709  hypothetical protein  40.77 
 
 		 255 aa  185  6e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2143  hypothetical protein  31.62 
 
 		 258 aa  134  9.999999999999999e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.812162  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0830  hypothetical protein  31.76 
 
 		 264 aa  124  1e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00562618  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003096  hypothetical protein  31.67 
 
 		 255 aa  122  7e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000102817  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02750  hypothetical protein  32.5 
 
 		 255 aa  117  1.9999999999999998e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3581  DNA polymerase beta domain protein region  30.09 
 
 		 287 aa  58.5  0.0000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2188  hypothetical protein  19.07 
 
 		 260 aa  54.3  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.434474  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2350  nucleotidyltransferase domain protein  18.53 
 
 		 272 aa  52.4  0.000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2485  nucleotidyltransferase domain protein  19.18 
 
 		 272 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>