21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan8802_4607 on replicon NC_013167
Organism: Cyanothece sp. PCC 8802



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013167  Cyan8802_4607  DNA polymerase beta domain protein region  100 
 
 
119 aa  241  1.9999999999999999e-63  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2919  DNA polymerase beta domain protein region  38.37 
 
 
173 aa  63.2  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0018  DNA polymerase beta domain protein region  33.33 
 
 
117 aa  57  0.00000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.21199  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1277  DNA polymerase beta subunit  33.33 
 
 
111 aa  52.8  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4164  DNA polymerase beta domain protein region  28.97 
 
 
113 aa  52  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2850  DNA polymerase beta domain protein region  25.47 
 
 
111 aa  50.4  0.000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.787876  normal  0.338784 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1200  DNA polymerase beta subunit  31.93 
 
 
111 aa  48.5  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.504672  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0104  DNA polymerase beta domain protein region  31.03 
 
 
114 aa  48.1  0.00004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1643  DNA polymerase beta domain protein region  31.19 
 
 
115 aa  48.1  0.00004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2316  DNA polymerase beta domain protein region  47.5 
 
 
155 aa  45.4  0.0003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.763015  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4035  DNA polymerase beta domain protein region  27.88 
 
 
113 aa  45.1  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0203  DNA polymerase beta subunit  31.82 
 
 
155 aa  44.7  0.0004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1565  DNA polymerase, beta-like region  36.9 
 
 
111 aa  44.7  0.0005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.318501 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0524  DNA polymerase beta subunit  36.26 
 
 
113 aa  44.3  0.0006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0678  DNA polymerase beta domain protein region  28.33 
 
 
114 aa  43.1  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000111019  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5818  DNA polymerase beta domain protein region  46.51 
 
 
96 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0500  DNA polymerase beta subunit  31.82 
 
 
110 aa  42  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000767476  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1926  DNA polymerase, beta-like region  43.18 
 
 
104 aa  40.8  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.327788  normal  0.570166 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2866  DNA polymerase beta domain protein region  33.64 
 
 
117 aa  40.8  0.007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2718  DNA polymerase, beta-like region  36.59 
 
 
109 aa  40.4  0.008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000888869  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2688  DNA polymerase beta domain protein region  35.48 
 
 
229 aa  40.4  0.009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.373799  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>