11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_5246 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_5246  DNA polymerase beta domain protein region  100 
 
 		 284 aa  582  1.0000000000000001e-165  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.93784  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0837  DNA polymerase beta domain protein region  83.92 
 
 		 286 aa  488  1e-137  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.664708 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1720  HEPN domain protein  65.85 
 
 		 305 aa  377  1e-103  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0261385  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6110  DNA polymerase beta subunit  36.36 
 
 		 303 aa  192  5e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.425167  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2595  hypothetical protein  37.29 
 
 		 310 aa  191  1e-47  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4231  nucleotidyltransferase  36.52 
 
 		 302 aa  181  1e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.00450243  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2515  hypothetical protein  35.55 
 
 		 308 aa  178  8e-44  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.957681 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3200  hypothetical protein  36.27 
 
 		 301 aa  177  2e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.853181  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5174  HEPN domain-containing protein  33.55 
 
 		 310 aa  150  3e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0411727  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0468  DNA polymerase beta domain protein region  32.31 
 
 		 304 aa  149  4e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.651395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3627  hypothetical protein  24.69 
 
 		 545 aa  48.5  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0267777  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>