15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_4231 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_4231  nucleotidyltransferase  100 
 
 		 302 aa  620  1e-177  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.00450243  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3200  hypothetical protein  68.35 
 
 		 301 aa  428  1e-119  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.853181  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6110  DNA polymerase beta subunit  69.15 
 
 		 303 aa  389  1e-107  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.425167  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2595  hypothetical protein  48.3 
 
 		 310 aa  285  7e-76  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2515  hypothetical protein  50 
 
 		 308 aa  276  3e-73  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.957681 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0468  DNA polymerase beta domain protein region  45.79 
 
 		 304 aa  239  2.9999999999999997e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.651395  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5174  HEPN domain-containing protein  42.67 
 
 		 310 aa  210  2e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0411727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1720  HEPN domain protein  34.68 
 
 		 305 aa  187  2e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0261385  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5246  DNA polymerase beta domain protein region  36.52 
 
 		 284 aa  181  1e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.93784  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0837  DNA polymerase beta domain protein region  34.9 
 
 		 286 aa  179  4e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.664708 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0174  hypothetical protein  34.87 
 
 		 161 aa  76.6  0.0000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.582709  normal  0.551801 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0576  DNA polymerase beta subunit  38.14 
 
 		 121 aa  46.2  0.0006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.887062  normal  0.28507 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3846  DNA polymerase beta subunit  38.14 
 
 		 121 aa  44.3  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000154582  unclonable  0.00000693944 
 
 
-
 
NC_011774  BCG9842_A0076  nucleotidyltransferase domain protein  31.37 
 
 		 110 aa  43.5  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.467951  normal  0.54284 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4164  DNA polymerase beta domain protein region  29.91 
 
 		 113 aa  42.7  0.008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>