14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_5174 on replicon NC_010335
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010335  Caul_5174  HEPN domain-containing protein  100 
 
 		 310 aa  630  1e-180  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0411727  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2595  hypothetical protein  46.41 
 
 		 310 aa  256  4e-67  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2515  hypothetical protein  47.4 
 
 		 308 aa  255  8e-67  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.957681 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0468  DNA polymerase beta domain protein region  42.21 
 
 		 304 aa  226  3e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.651395  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4231  nucleotidyltransferase  42.67 
 
 		 302 aa  210  2e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.00450243  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6110  DNA polymerase beta subunit  42.52 
 
 		 303 aa  208  1e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.425167  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3200  hypothetical protein  41.33 
 
 		 301 aa  204  1e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.853181  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5246  DNA polymerase beta domain protein region  33.55 
 
 		 284 aa  150  4e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.93784  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0837  DNA polymerase beta domain protein region  32.45 
 
 		 286 aa  145  6e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.664708 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1720  HEPN domain protein  30.23 
 
 		 305 aa  143  4e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0261385  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0174  hypothetical protein  28.28 
 
 		 161 aa  48.9  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.582709  normal  0.551801 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0317  DNA polymerase beta domain protein region  26.8 
 
 		 121 aa  45.1  0.002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1748  DNA polymerase beta subunit  32.99 
 
 		 112 aa  43.9  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000372139  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0576  DNA polymerase beta subunit  36.56 
 
 		 121 aa  42.7  0.009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.887062  normal  0.28507 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>