34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_1748 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_1748  DNA polymerase beta subunit  100 
 
 		 112 aa  224  2e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000372139  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0606  DNA polymerase beta domain protein region  44.57 
 
 		 105 aa  87.8  4e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000675523 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0216  hypothetical protein  43.88 
 
 		 103 aa  85.5  2e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0242312  hitchhiker  0.0000000000000575833 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0618  DNA polymerase beta domain protein region  37.62 
 
 		 106 aa  82.4  0.000000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.686113  normal  0.81414 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3846  DNA polymerase beta subunit  45.56 
 
 		 121 aa  67.8  0.00000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000154582  unclonable  0.00000693944 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0576  DNA polymerase beta subunit  43.68 
 
 		 121 aa  65.5  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.887062  normal  0.28507 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0574  DNA polymerase beta subunit  42.7 
 
 		 120 aa  65.9  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.412375  normal  0.178688 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0083  hypothetical protein  33.66 
 
 		 111 aa  56.6  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.394074  normal  0.26212 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4127  hypothetical protein  42.53 
 
 		 191 aa  54.7  0.0000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000129079 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0236  DNA polymerase beta subunit  45.1 
 
 		 103 aa  50.4  0.000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3842  DNA polymerase beta subunit  35.06 
 
 		 127 aa  47.8  0.00005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000823006 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2432  DNA polymerase beta subunit  29.41 
 
 		 111 aa  47.4  0.00007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.71469  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3922  DNA polymerase beta subunit  25 
 
 		 117 aa  47  0.00008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0657046 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0718  DNA polymerase beta subunit  41.89 
 
 		 112 aa  47.4  0.00008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.525185 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0404  nucleotidyltransferase domain-containing protein  24.51 
 
 		 148 aa  46.2  0.0001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.108066  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3041  DNA polymerase beta subunit  32.53 
 
 		 116 aa  46.2  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1577  DNA polymerase, beta-like region  51.35 
 
 		 104 aa  45.4  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000241752  normal  0.133279 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0997  DNA polymerase beta subunit  33.33 
 
 		 115 aa  45.1  0.0003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.995341  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1450  DNA polymerase beta subunit  25 
 
 		 115 aa  45.1  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.374866 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1920  DNA polymerase beta subunit  30.21 
 
 		 116 aa  45.1  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000388354 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0354  DNA polymerase beta subunit  39.09 
 
 		 105 aa  45.1  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3858  DNA polymerase beta domain protein region  30.77 
 
 		 103 aa  44.3  0.0006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0908144  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2147  DNA polymerase beta domain protein region  38.46 
 
 		 112 aa  44.3  0.0006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5174  HEPN domain-containing protein  32.99 
 
 		 310 aa  43.9  0.0007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0411727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1617  DNA polymerase beta domain-containing protein region  40.7 
 
 		 103 aa  43.9  0.0007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.450393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2347  DNA polymerase beta subunit  32.53 
 
 		 116 aa  43.5  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.048778  normal  0.250853 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2718  DNA polymerase, beta-like region  32.38 
 
 		 109 aa  43.1  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000888869  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0317  DNA polymerase beta domain protein region  29.63 
 
 		 121 aa  42.7  0.002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2470  DNA polymerase beta subunit  35.51 
 
 		 105 aa  41.6  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.22963  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3200  hypothetical protein  31.68 
 
 		 301 aa  41.2  0.004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.853181  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2669  DNA polymerase beta domain protein region  28.95 
 
 		 110 aa  41.6  0.004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0018  DNA polymerase beta domain protein region  66.67 
 
 		 117 aa  41.2  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.21199  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1681  DNA polymerase, beta-like region  26.97 
 
 		 107 aa  40.8  0.006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.044025  normal  1 
 
 
-
 
NC_011774  BCG9842_A0076  nucleotidyltransferase domain protein  36.47 
 
 		 110 aa  40.4  0.009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.467951  normal  0.54284 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>