46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_1681 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007796  Mhun_1681  DNA polymerase, beta-like region  100 
 
 		 107 aa  221  2e-57  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.044025  normal  1 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0102  nucleotidyltransferase domain-containing protein  40.23 
 
 		 128 aa  63.9  0.0000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0913883  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0063  nucleotidyltransferase domain protein  40.23 
 
 		 128 aa  63.9  0.0000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0040  nucleotidyltransferase domain protein  40.23 
 
 		 128 aa  63.9  0.0000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000549944 
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0037  nucleotidyltransferase domain-containing protein  42.17 
 
 		 132 aa  63.5  0.0000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1725  DNA polymerase beta subunit  33.64 
 
 		 111 aa  62.8  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000013917  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1020  DNA polymerase beta subunit  36.08 
 
 		 106 aa  60.8  0.000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011774  BCG9842_A0076  nucleotidyltransferase domain protein  39.29 
 
 		 110 aa  60.5  0.000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.467951  normal  0.54284 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1617  DNA polymerase beta domain-containing protein region  32.67 
 
 		 103 aa  60.5  0.000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.450393  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1577  DNA polymerase, beta-like region  31.73 
 
 		 104 aa  58.5  0.00000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000241752  normal  0.133279 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3922  DNA polymerase beta subunit  31.37 
 
 		 117 aa  58.5  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0657046 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1920  DNA polymerase beta subunit  33.01 
 
 		 116 aa  57.8  0.00000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000388354 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0354  DNA polymerase beta subunit  30.39 
 
 		 105 aa  57.4  0.00000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2470  DNA polymerase beta subunit  30.39 
 
 		 105 aa  57  0.00000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.22963  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2432  DNA polymerase beta subunit  33.02 
 
 		 111 aa  55.5  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.71469  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1028  DNA polymerase beta domain protein region  31.37 
 
 		 111 aa  55.5  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000129156  normal  0.703188 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2347  DNA polymerase beta subunit  33.01 
 
 		 116 aa  55.8  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.048778  normal  0.250853 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1450  DNA polymerase beta subunit  32.69 
 
 		 115 aa  55.5  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.374866 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0737  nucleotidyltransferase  35.63 
 
 		 107 aa  53.5  0.0000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0997  DNA polymerase beta subunit  36.63 
 
 		 115 aa  53.1  0.000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.995341  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0574  DNA polymerase beta subunit  34.34 
 
 		 120 aa  52  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.412375  normal  0.178688 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3041  DNA polymerase beta subunit  32.69 
 
 		 116 aa  51.6  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0499  nucleotidyltransferase domain-containing protein  32.58 
 
 		 102 aa  50.8  0.000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0606  DNA polymerase beta domain protein region  31.91 
 
 		 105 aa  49.7  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000675523 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0793  DNA polymerase, beta-like region  30.69 
 
 		 110 aa  49.7  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.304754 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0083  hypothetical protein  31.63 
 
 		 111 aa  49.7  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.394074  normal  0.26212 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0365  DNA polymerase beta subunit  28.12 
 
 		 113 aa  48.5  0.00003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.200117 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1301  DNA polymerase beta subunit  29.67 
 
 		 111 aa  48.5  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.232434  normal  0.452159 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0236  DNA polymerase beta subunit  32.22 
 
 		 103 aa  47.8  0.00005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1772  DNA polymerase beta domain protein region  33.02 
 
 		 99 aa  47.4  0.00006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2669  DNA polymerase beta domain protein region  26 
 
 		 110 aa  47  0.00008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3233  nucleotidyltransferase domain protein  28.71 
 
 		 166 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.73519  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2147  DNA polymerase beta domain protein region  29 
 
 		 112 aa  46.2  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0216  hypothetical protein  28.57 
 
 		 103 aa  45.8  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0242312  hitchhiker  0.0000000000000575833 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0576  DNA polymerase beta subunit  27.55 
 
 		 121 aa  44.7  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.887062  normal  0.28507 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1619  DNA polymerase beta domain-containing protein region  28.57 
 
 		 105 aa  45.1  0.0004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.316623  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3846  DNA polymerase beta subunit  26.53 
 
 		 121 aa  44.3  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000154582  unclonable  0.00000693944 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3842  DNA polymerase beta subunit  27.62 
 
 		 127 aa  44.3  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000823006 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3225  nucleotidyltransferase domain-containing protein  29.76 
 
 		 166 aa  44.3  0.0006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00907014  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3962  DNA polymerase beta domain protein region  32.86 
 
 		 105 aa  44.3  0.0006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2191  DNA polymerase beta subunit  28.57 
 
 		 111 aa  43.9  0.0007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.190588  normal  0.488652 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4127  hypothetical protein  31.71 
 
 		 191 aa  43.1  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000129079 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1359  nucleotidyltransferase, putative  28.28 
 
 		 134 aa  42.7  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1363  nucleotidyltransferase, putative  28.28 
 
 		 134 aa  42.4  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  decreased coverage  0.00238094  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4901  DNA polymerase, beta-like region  27.06 
 
 		 118 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.974708 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1748  DNA polymerase beta subunit  26.97 
 
 		 112 aa  40.8  0.006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000372139  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>