36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_2669 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_2669  DNA polymerase beta domain protein region  100 
 
 		 110 aa  221  2e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3842  DNA polymerase beta subunit  36.7 
 
 		 127 aa  79  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000823006 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2147  DNA polymerase beta domain protein region  39.05 
 
 		 112 aa  59.7  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0576  DNA polymerase beta subunit  33.66 
 
 		 121 aa  57  0.00000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.887062  normal  0.28507 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0618  DNA polymerase beta domain protein region  32.38 
 
 		 106 aa  55.8  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.686113  normal  0.81414 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1028  DNA polymerase beta domain protein region  26.85 
 
 		 111 aa  54.7  0.0000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000129156  normal  0.703188 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0236  DNA polymerase beta subunit  29.81 
 
 		 103 aa  50.4  0.000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0102  nucleotidyltransferase domain-containing protein  30.84 
 
 		 128 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0913883  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0040  nucleotidyltransferase domain protein  30.84 
 
 		 128 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000549944 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0063  nucleotidyltransferase domain protein  30.84 
 
 		 128 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3846  DNA polymerase beta subunit  29.7 
 
 		 121 aa  49.7  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000154582  unclonable  0.00000693944 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4901  DNA polymerase, beta-like region  29.41 
 
 		 118 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.974708 
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0037  nucleotidyltransferase domain-containing protein  30.39 
 
 		 132 aa  49.3  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0871  hypothetical protein  30.39 
 
 		 105 aa  48.5  0.00003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.845588  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1725  DNA polymerase beta subunit  29.2 
 
 		 111 aa  48.1  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000013917  n/a   
 
 
-
 
NC_011774  BCG9842_A0076  nucleotidyltransferase domain protein  30.84 
 
 		 110 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.467951  normal  0.54284 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0574  DNA polymerase beta subunit  38.3 
 
 		 120 aa  47.4  0.00007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.412375  normal  0.178688 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1681  DNA polymerase, beta-like region  26 
 
 		 107 aa  47  0.00008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.044025  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1617  DNA polymerase beta domain-containing protein region  31.43 
 
 		 103 aa  46.6  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.450393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0083  hypothetical protein  40.82 
 
 		 111 aa  46.6  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.394074  normal  0.26212 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0365  DNA polymerase beta subunit  39.74 
 
 		 113 aa  46.2  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.200117 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1020  DNA polymerase beta subunit  34.65 
 
 		 106 aa  46.2  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0606  DNA polymerase beta domain protein region  28.16 
 
 		 105 aa  46.2  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000675523 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3233  nucleotidyltransferase domain protein  29.41 
 
 		 166 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.73519  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0737  nucleotidyltransferase  23.08 
 
 		 107 aa  44.7  0.0004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1577  DNA polymerase, beta-like region  25.26 
 
 		 104 aa  44.3  0.0006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000241752  normal  0.133279 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0997  DNA polymerase beta subunit  27.45 
 
 		 115 aa  43.9  0.0008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.995341  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0216  hypothetical protein  38.3 
 
 		 103 aa  43.1  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0242312  hitchhiker  0.0000000000000575833 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2347  DNA polymerase beta subunit  29.29 
 
 		 116 aa  43.5  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.048778  normal  0.250853 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0793  DNA polymerase, beta-like region  25.51 
 
 		 110 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.304754 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2718  DNA polymerase, beta-like region  31.4 
 
 		 109 aa  43.5  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000888869  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3962  DNA polymerase beta domain protein region  31.31 
 
 		 105 aa  43.5  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2352  DNA polymerase, beta-like region  30.09 
 
 		 148 aa  41.6  0.003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00951181  normal  0.0970434 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0893  DNA polymerase beta domain-containing protein region  42.55 
 
 		 143 aa  41.6  0.004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1748  DNA polymerase beta subunit  28.95 
 
 		 112 aa  41.6  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000372139  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3225  nucleotidyltransferase domain-containing protein  28.43 
 
 		 166 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00907014  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>