73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_2347 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_2347  DNA polymerase beta subunit  100 
 
 		 116 aa  236  5.999999999999999e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.048778  normal  0.250853 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3041  DNA polymerase beta subunit  70.27 
 
 		 116 aa  164  2.9999999999999998e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1920  DNA polymerase beta subunit  67.54 
 
 		 116 aa  154  3e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000388354 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1725  DNA polymerase beta subunit  50 
 
 		 111 aa  97.8  4e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000013917  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2432  DNA polymerase beta subunit  47.22 
 
 		 111 aa  89  2e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.71469  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1020  DNA polymerase beta subunit  51.55 
 
 		 106 aa  80.5  0.000000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1577  DNA polymerase, beta-like region  41.35 
 
 		 104 aa  79  0.00000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000241752  normal  0.133279 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2718  DNA polymerase, beta-like region  41.05 
 
 		 109 aa  72.8  0.000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000888869  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0576  DNA polymerase beta subunit  38.68 
 
 		 121 aa  70.9  0.000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.887062  normal  0.28507 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3842  DNA polymerase beta subunit  36.54 
 
 		 127 aa  69.3  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000823006 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0574  DNA polymerase beta subunit  44.86 
 
 		 120 aa  69.7  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.412375  normal  0.178688 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1617  DNA polymerase beta domain-containing protein region  38.54 
 
 		 103 aa  67.8  0.00000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.450393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0354  DNA polymerase beta subunit  38.24 
 
 		 105 aa  67.4  0.00000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2470  DNA polymerase beta subunit  38.24 
 
 		 105 aa  67  0.00000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.22963  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3846  DNA polymerase beta subunit  37.61 
 
 		 121 aa  65.9  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000154582  unclonable  0.00000693944 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1028  DNA polymerase beta domain protein region  31.96 
 
 		 111 aa  63.2  0.000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000129156  normal  0.703188 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0236  DNA polymerase beta subunit  36.67 
 
 		 103 aa  62.8  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0365  DNA polymerase beta subunit  32.29 
 
 		 113 aa  58.5  0.00000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.200117 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1681  DNA polymerase, beta-like region  33.01 
 
 		 107 aa  55.8  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.044025  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0606  DNA polymerase beta domain protein region  34.91 
 
 		 105 aa  55.8  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000675523 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1397  DNA polymerase, beta-like region  39.29 
 
 		 113 aa  53.9  0.0000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0063  nucleotidyltransferase domain protein  39 
 
 		 128 aa  52.8  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0040  nucleotidyltransferase domain protein  39 
 
 		 128 aa  52.8  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000549944 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0102  nucleotidyltransferase domain-containing protein  39 
 
 		 128 aa  52.8  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0913883  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4091  DNA polymerase beta subunit  43.9 
 
 		 121 aa  52.4  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.761535  normal  0.446242 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4127  hypothetical protein  34.95 
 
 		 191 aa  51.2  0.000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000129079 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3962  DNA polymerase beta domain protein region  37.97 
 
 		 105 aa  50.8  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3917  hypothetical protein  37.23 
 
 		 230 aa  50.4  0.000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.038879 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0216  hypothetical protein  32.67 
 
 		 103 aa  50.4  0.000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0242312  hitchhiker  0.0000000000000575833 
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0037  nucleotidyltransferase domain-containing protein  38.24 
 
 		 132 aa  49.7  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0317  DNA polymerase beta domain protein region  39.24 
 
 		 121 aa  49.3  0.00002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0997  DNA polymerase beta subunit  33.65 
 
 		 115 aa  48.1  0.00004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.995341  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0083  hypothetical protein  33.63 
 
 		 111 aa  47.8  0.00005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.394074  normal  0.26212 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1619  DNA polymerase beta domain-containing protein region  32.35 
 
 		 105 aa  47  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.316623  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2281  nucleotidyltransferase  29 
 
 		 132 aa  46.2  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0106509  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2147  DNA polymerase beta domain protein region  34.02 
 
 		 112 aa  46.2  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0618  DNA polymerase beta domain protein region  31.19 
 
 		 106 aa  45.8  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.686113  normal  0.81414 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2316  DNA polymerase beta domain protein region  60.71 
 
 		 155 aa  45.1  0.0003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.763015  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1861  DNA polymerase beta subunit  30.59 
 
 		 140 aa  45.1  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0737  nucleotidyltransferase  31.03 
 
 		 107 aa  45.1  0.0003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0145  hypothetical protein  40.68 
 
 		 131 aa  45.4  0.0003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.345001  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1691  DNA polymerase beta subunit  34.38 
 
 		 130 aa  45.1  0.0003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.0000100624  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3436  DNA polymerase beta subunit  34.57 
 
 		 107 aa  45.1  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.212553 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1363  nucleotidyltransferase, putative  36.26 
 
 		 134 aa  45.1  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  decreased coverage  0.00238094  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1866  DNA polymerase beta domain protein region  33.33 
 
 		 119 aa  44.3  0.0005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0893  DNA polymerase beta domain-containing protein region  51.28 
 
 		 143 aa  44.3  0.0006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0428  DNA polymerase, beta-like region  30.77 
 
 		 153 aa  44.3  0.0006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0480568  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1450  DNA polymerase beta subunit  33.64 
 
 		 115 aa  43.9  0.0008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.374866 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0463  DNA polymerase beta subunit  31.37 
 
 		 127 aa  42.7  0.001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2209  DNA polymerase beta domain protein region  46.51 
 
 		 113 aa  43.1  0.001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2669  DNA polymerase beta domain protein region  29.29 
 
 		 110 aa  43.5  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1748  DNA polymerase beta subunit  32.53 
 
 		 112 aa  43.5  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000372139  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0678  DNA polymerase beta domain protein region  48.78 
 
 		 114 aa  43.1  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000111019  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1359  nucleotidyltransferase, putative  35.16 
 
 		 134 aa  43.5  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0499  nucleotidyltransferase domain-containing protein  28.71 
 
 		 102 aa  43.1  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3303  DNA polymerase beta domain protein region  34.02 
 
 		 114 aa  42.4  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.433068 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1926  DNA polymerase, beta-like region  46.94 
 
 		 104 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.327788  normal  0.570166 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0410  DNA polymerase beta domain protein region  47.62 
 
 		 99 aa  42.7  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0377934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0718  DNA polymerase beta subunit  41.79 
 
 		 112 aa  42  0.002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.525185 
 
 
-
 
NC_011774  BCG9842_A0076  nucleotidyltransferase domain protein  29.41 
 
 		 110 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.467951  normal  0.54284 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3922  DNA polymerase beta subunit  32.38 
 
 		 117 aa  42.7  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0657046 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0218  DNA polymerase beta subunit  33.73 
 
 		 110 aa  41.6  0.003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2641  DNA polymerase beta domain protein region  32.97 
 
 		 125 aa  42  0.003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0506  DNA polymerase beta subunit  34.18 
 
 		 121 aa  41.6  0.003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00399144 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20670  nucleotidyltransferase family protein  54.29 
 
 		 254 aa  41.6  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.117962  normal  0.282766 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0269  nucleotidyltransferase  33.33 
 
 		 135 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0897  DNA polymerase beta subunit  31.4 
 
 		 123 aa  41.6  0.004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3225  nucleotidyltransferase domain-containing protein  38.67 
 
 		 166 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00907014  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1784  nucleotidyltransferase  37.1 
 
 		 97 aa  40.8  0.006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4420  DNA polymerase beta subunit  35.05 
 
 		 118 aa  40.8  0.006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.478946  normal  0.142305 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0489  DNA polymerase beta subunit  61.54 
 
 		 111 aa  40.8  0.006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0565  protein-P-II uridylyltransferase  32.67 
 
 		 877 aa  40.8  0.007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.184337  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1044  DNA polymerase beta subunit  48.89 
 
 		 122 aa  40.4  0.008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>