55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_1725 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_1725  DNA polymerase beta subunit  100 
 
 		 111 aa  224  3e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000013917  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2432  DNA polymerase beta subunit  61.26 
 
 		 111 aa  146  1.0000000000000001e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.71469  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3041  DNA polymerase beta subunit  49.07 
 
 		 116 aa  97.4  5e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2347  DNA polymerase beta subunit  50 
 
 		 116 aa  97.8  5e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.048778  normal  0.250853 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1920  DNA polymerase beta subunit  43.93 
 
 		 116 aa  84.3  5e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000388354 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1577  DNA polymerase, beta-like region  40.19 
 
 		 104 aa  79.7  0.00000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000241752  normal  0.133279 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0354  DNA polymerase beta subunit  40.57 
 
 		 105 aa  77.8  0.00000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2470  DNA polymerase beta subunit  39.62 
 
 		 105 aa  76.3  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.22963  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0365  DNA polymerase beta subunit  38 
 
 		 113 aa  69.7  0.00000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.200117 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1020  DNA polymerase beta subunit  42.86 
 
 		 106 aa  68.6  0.00000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0236  DNA polymerase beta subunit  34 
 
 		 103 aa  67.4  0.00000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1617  DNA polymerase beta domain-containing protein region  38 
 
 		 103 aa  63.2  0.000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.450393  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1681  DNA polymerase, beta-like region  33.64 
 
 		 107 aa  62.8  0.000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.044025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0574  DNA polymerase beta subunit  38.46 
 
 		 120 aa  62.8  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.412375  normal  0.178688 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0576  DNA polymerase beta subunit  37.37 
 
 		 121 aa  61.2  0.000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.887062  normal  0.28507 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1619  DNA polymerase beta domain-containing protein region  39.81 
 
 		 105 aa  60.5  0.000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.316623  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0997  DNA polymerase beta subunit  37.29 
 
 		 115 aa  60.1  0.00000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.995341  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2718  DNA polymerase, beta-like region  36.94 
 
 		 109 aa  59.7  0.00000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000888869  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3846  DNA polymerase beta subunit  35.24 
 
 		 121 aa  58.5  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000154582  unclonable  0.00000693944 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4091  DNA polymerase beta subunit  41.9 
 
 		 121 aa  58.5  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.761535  normal  0.446242 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4127  hypothetical protein  34.86 
 
 		 191 aa  55.8  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000129079 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1028  DNA polymerase beta domain protein region  32.38 
 
 		 111 aa  55.5  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000129156  normal  0.703188 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0063  nucleotidyltransferase domain protein  34.48 
 
 		 128 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0040  nucleotidyltransferase domain protein  34.48 
 
 		 128 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000549944 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2147  DNA polymerase beta domain protein region  37.62 
 
 		 112 aa  55.1  0.0000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0102  nucleotidyltransferase domain-containing protein  34.48 
 
 		 128 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0913883  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3842  DNA polymerase beta subunit  32.41 
 
 		 127 aa  55.5  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000823006 
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0037  nucleotidyltransferase domain-containing protein  35.09 
 
 		 132 aa  54.3  0.0000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011774  BCG9842_A0076  nucleotidyltransferase domain protein  36.67 
 
 		 110 aa  53.5  0.0000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.467951  normal  0.54284 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1450  DNA polymerase beta subunit  30.56 
 
 		 115 aa  52.4  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.374866 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0216  hypothetical protein  29.91 
 
 		 103 aa  51.6  0.000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0242312  hitchhiker  0.0000000000000575833 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3962  DNA polymerase beta domain protein region  38.55 
 
 		 105 aa  51.2  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3922  DNA polymerase beta subunit  31.48 
 
 		 117 aa  50.4  0.000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0657046 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0606  DNA polymerase beta domain protein region  29.25 
 
 		 105 aa  50.1  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000675523 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0737  nucleotidyltransferase  31.25 
 
 		 107 aa  48.9  0.00002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2669  DNA polymerase beta domain protein region  29.2 
 
 		 110 aa  48.1  0.00004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0083  hypothetical protein  29.52 
 
 		 111 aa  47.4  0.00007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.394074  normal  0.26212 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0893  DNA polymerase beta domain-containing protein region  40.74 
 
 		 143 aa  46.6  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1697  DNA polymerase beta subunit  45.31 
 
 		 92 aa  46.2  0.0001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00000599045  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2191  DNA polymerase beta subunit  33.33 
 
 		 111 aa  45.1  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.190588  normal  0.488652 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3233  nucleotidyltransferase domain protein  33.71 
 
 		 166 aa  45.1  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.73519  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0897  DNA polymerase beta subunit  33.33 
 
 		 123 aa  44.3  0.0005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1972  DNA polymerase beta domain protein region  48.08 
 
 		 131 aa  44.3  0.0005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.18731 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3858  DNA polymerase beta domain protein region  26.73 
 
 		 103 aa  44.3  0.0006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0908144  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0499  nucleotidyltransferase domain-containing protein  29.35 
 
 		 102 aa  43.5  0.0009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3436  DNA polymerase beta subunit  34.57 
 
 		 107 aa  42.4  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.212553 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0317  DNA polymerase beta domain protein region  28.42 
 
 		 121 aa  42.7  0.002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1044  DNA polymerase beta subunit  47.37 
 
 		 122 aa  42.7  0.002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1363  nucleotidyltransferase, putative  29.46 
 
 		 134 aa  41.6  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  decreased coverage  0.00238094  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1359  nucleotidyltransferase, putative  29.46 
 
 		 134 aa  41.6  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3303  DNA polymerase beta domain protein region  28.57 
 
 		 114 aa  41.6  0.004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.433068 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0489  DNA polymerase beta subunit  30.59 
 
 		 111 aa  41.6  0.004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3225  nucleotidyltransferase domain-containing protein  32.58 
 
 		 166 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00907014  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1866  DNA polymerase beta domain protein region  33.33 
 
 		 119 aa  40.8  0.006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0618  DNA polymerase beta domain protein region  28.04 
 
 		 106 aa  40.8  0.007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.686113  normal  0.81414 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>