57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_1619 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_1619  DNA polymerase beta domain-containing protein region  100 
 
 		 105 aa  215  2e-55  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.316623  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1617  DNA polymerase beta domain-containing protein region  60.95 
 
 		 103 aa  123  1e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.450393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0576  DNA polymerase beta subunit  40.82 
 
 		 121 aa  62.8  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.887062  normal  0.28507 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3846  DNA polymerase beta subunit  38 
 
 		 121 aa  62.4  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000154582  unclonable  0.00000693944 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1577  DNA polymerase, beta-like region  32.99 
 
 		 104 aa  62  0.000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000241752  normal  0.133279 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1725  DNA polymerase beta subunit  39.81 
 
 		 111 aa  60.5  0.000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000013917  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0236  DNA polymerase beta subunit  28.85 
 
 		 103 aa  55.8  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0354  DNA polymerase beta subunit  34.69 
 
 		 105 aa  52  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3041  DNA polymerase beta subunit  33.33 
 
 		 116 aa  51.6  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1920  DNA polymerase beta subunit  33.33 
 
 		 116 aa  49.7  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000388354 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0083  hypothetical protein  30 
 
 		 111 aa  50.1  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.394074  normal  0.26212 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0618  DNA polymerase beta domain protein region  36.36 
 
 		 106 aa  49.3  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.686113  normal  0.81414 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0365  DNA polymerase beta subunit  30.39 
 
 		 113 aa  48.5  0.00003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.200117 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2470  DNA polymerase beta subunit  35.71 
 
 		 105 aa  48.1  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.22963  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2432  DNA polymerase beta subunit  29 
 
 		 111 aa  47.8  0.00005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.71469  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2209  DNA polymerase beta domain protein region  42.62 
 
 		 113 aa  47.8  0.00006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1020  DNA polymerase beta subunit  31.58 
 
 		 106 aa  47.8  0.00006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0871  hypothetical protein  34.02 
 
 		 105 aa  46.6  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.845588  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2347  DNA polymerase beta subunit  32.35 
 
 		 116 aa  47  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.048778  normal  0.250853 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2147  DNA polymerase beta domain protein region  36.27 
 
 		 112 aa  47  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0793  DNA polymerase, beta-like region  25.25 
 
 		 110 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.304754 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0837  DNA polymerase beta domain protein region  35.23 
 
 		 286 aa  46.2  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.664708 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1397  DNA polymerase, beta-like region  34.74 
 
 		 113 aa  45.8  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0997  DNA polymerase beta subunit  36 
 
 		 115 aa  45.1  0.0003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.995341  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0606  DNA polymerase beta domain protein region  33.33 
 
 		 105 aa  45.1  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000675523 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1681  DNA polymerase, beta-like region  28.57 
 
 		 107 aa  45.1  0.0004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.044025  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3303  DNA polymerase beta domain protein region  45.45 
 
 		 114 aa  43.9  0.0007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.433068 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1336  DNA polymerase beta subunit  33.33 
 
 		 120 aa  43.9  0.0007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0574  DNA polymerase beta subunit  34.41 
 
 		 120 aa  43.9  0.0007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.412375  normal  0.178688 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2191  DNA polymerase beta subunit  32.94 
 
 		 111 aa  43.9  0.0008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.190588  normal  0.488652 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3842  DNA polymerase beta subunit  27.27 
 
 		 127 aa  43.9  0.0008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000823006 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5631  DNA polymerase beta domain protein region  42.86 
 
 		 102 aa  43.9  0.0008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000350885  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3436  DNA polymerase beta subunit  60.71 
 
 		 107 aa  43.5  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.212553 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2718  DNA polymerase, beta-like region  35.71 
 
 		 109 aa  43.5  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000888869  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0718  DNA polymerase beta subunit  38.37 
 
 		 112 aa  43.1  0.001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.525185 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0216  hypothetical protein  36.47 
 
 		 103 aa  43.1  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0242312  hitchhiker  0.0000000000000575833 
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0037  nucleotidyltransferase domain-containing protein  30.19 
 
 		 132 aa  42.7  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3922  DNA polymerase beta subunit  30.95 
 
 		 117 aa  42.4  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0657046 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1028  DNA polymerase beta domain protein region  30.3 
 
 		 111 aa  42.4  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000129156  normal  0.703188 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1691  DNA polymerase beta subunit  51.28 
 
 		 130 aa  42.4  0.002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.0000100624  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0506  DNA polymerase beta subunit  40 
 
 		 96 aa  42  0.003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0033  transcriptional regulator, XRE family  39.73 
 
 		 169 aa  42  0.003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.400371  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0867  DNA polymerase beta domain protein region  40 
 
 		 96 aa  42  0.003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0489  DNA polymerase beta subunit  43.59 
 
 		 111 aa  41.6  0.004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0145  hypothetical protein  48.39 
 
 		 131 aa  41.6  0.004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.345001  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0233  DNA polymerase beta domain protein region  27.52 
 
 		 108 aa  41.6  0.004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4035  DNA polymerase beta subunit  34.72 
 
 		 103 aa  41.2  0.005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0463  DNA polymerase beta subunit  78.26 
 
 		 127 aa  41.2  0.005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3962  DNA polymerase beta domain protein region  53.33 
 
 		 105 aa  40.8  0.006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2162  DNA polymerase beta subunit  36.51 
 
 		 114 aa  40.4  0.007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2734  DNA polymerase beta domain protein region  45.76 
 
 		 144 aa  40.8  0.007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.174135  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0102  nucleotidyltransferase domain-containing protein  50 
 
 		 128 aa  40.4  0.008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0913883  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1926  DNA polymerase, beta-like region  57.58 
 
 		 104 aa  40.4  0.008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.327788  normal  0.570166 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0040  nucleotidyltransferase domain protein  50 
 
 		 128 aa  40.4  0.008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000549944 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0063  nucleotidyltransferase domain protein  50 
 
 		 128 aa  40.4  0.008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0897  DNA polymerase beta subunit  29.41 
 
 		 123 aa  40.4  0.008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3654  hypothetical protein  80 
 
 		 137 aa  40.4  0.009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.544333  normal  0.731043 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>