59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_1772 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_1772  DNA polymerase beta domain protein region  100 
 
 		 99 aa  193  8.000000000000001e-49  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0284  DNA polymerase beta domain protein region  41.03 
 
 		 99 aa  60.1  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0295  DNA polymerase beta domain protein region  39.74 
 
 		 98 aa  59.3  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0658  DNA polymerase beta subunit  35.48 
 
 		 137 aa  53.9  0.0000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000311195  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1936  putative nucleotidyltransferase  44.16 
 
 		 107 aa  53.9  0.0000007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1381  DNA polymerase beta domain protein region  40.51 
 
 		 97 aa  53.1  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1735  DNA polymerase beta domain protein region  32.14 
 
 		 106 aa  53.1  0.000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1570  DNA polymerase beta domain protein region  35.11 
 
 		 102 aa  53.1  0.000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2535  DNA polymerase, beta-like region  37.93 
 
 		 116 aa  52.8  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000686331  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1560  DNA polymerase beta domain protein region  36.84 
 
 		 105 aa  52.4  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0268  DNA polymerase beta domain protein region  32.14 
 
 		 100 aa  50.8  0.000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3922  DNA polymerase beta subunit  36.46 
 
 		 117 aa  50.8  0.000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0657046 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1105  DNA polymerase beta subunit  34.04 
 
 		 162 aa  49.7  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00137564  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1577  DNA polymerase, beta-like region  33.33 
 
 		 104 aa  50.1  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000241752  normal  0.133279 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0997  DNA polymerase beta subunit  34.58 
 
 		 115 aa  47.8  0.00005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.995341  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0069  DNA polymerase beta domain protein region  33.33 
 
 		 108 aa  47.8  0.00005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3846  DNA polymerase beta subunit  28.04 
 
 		 121 aa  47.4  0.00006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000154582  unclonable  0.00000693944 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1681  DNA polymerase, beta-like region  33.02 
 
 		 107 aa  47.4  0.00006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.044025  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0233  DNA polymerase beta domain protein region  32.18 
 
 		 108 aa  47.4  0.00007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0292  DNA polymerase beta subunit  32.18 
 
 		 108 aa  46.6  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3592  DNA polymerase beta domain protein region  36.23 
 
 		 96 aa  45.8  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000372185  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0551  DNA polymerase beta domain protein region  33.33 
 
 		 106 aa  45.4  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0897  HsdR-like, putative type I restriction deoxyribonuclease  30.43 
 
 		 1294 aa  45.8  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3353  DNA polymerase beta subunit  30.77 
 
 		 112 aa  45.1  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1999  DNA polymerase beta domain protein region  36.14 
 
 		 155 aa  45.1  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.95495  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1736  hypothetical protein  38.81 
 
 		 271 aa  45.1  0.0003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.76389  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2422  DNA polymerase beta subunit  36.47 
 
 		 135 aa  44.7  0.0004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1589  DNA polymerase beta domain protein region  36.62 
 
 		 96 aa  44.7  0.0005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0806  nucleotidyltransferase substrate binding protein, HI0074 family  36.71 
 
 		 247 aa  44.7  0.0005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3041  DNA polymerase beta subunit  30.53 
 
 		 116 aa  44.3  0.0006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3257  DNA polymerase, beta-like region  35.44 
 
 		 132 aa  43.9  0.0007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00329127  hitchhiker  2.42256e-16 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0763  DNA polymerase beta domain protein region  28.42 
 
 		 111 aa  43.5  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.667533  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3303  DNA polymerase beta domain protein region  36.17 
 
 		 114 aa  43.1  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.433068 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0365  DNA polymerase beta subunit  33.33 
 
 		 113 aa  42.7  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.200117 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0576  DNA polymerase beta subunit  28.3 
 
 		 121 aa  43.5  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.887062  normal  0.28507 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2490  DNA polymerase beta domain protein region  33.02 
 
 		 110 aa  42.4  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3015  DNA polymerase beta subunit  33.82 
 
 		 142 aa  42.7  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.914629  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0250  DNA polymerase beta subunit  33.77 
 
 		 137 aa  42.7  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5679  putative nucleotidyltransferase  30.61 
 
 		 135 aa  42.7  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0666104  decreased coverage  0.000482275 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2165  DNA polymerase beta subunit  35.71 
 
 		 151 aa  42.4  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1075  DNA polymerase beta subunit  32.22 
 
 		 132 aa  42.7  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141135 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4127  hypothetical protein  29.7 
 
 		 191 aa  42  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000129079 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2432  DNA polymerase beta subunit  38.1 
 
 		 111 aa  42  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.71469  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0893  DNA polymerase beta domain-containing protein region  29.35 
 
 		 143 aa  42  0.003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2025  DNA polymerase beta domain protein region  36.84 
 
 		 82 aa  41.6  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0505934  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2281  nucleotidyltransferase  37.5 
 
 		 132 aa  42  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0106509  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1133  DNA polymerase beta subunit  33.33 
 
 		 123 aa  42  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1926  DNA polymerase, beta-like region  38.78 
 
 		 104 aa  41.2  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.327788  normal  0.570166 
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4484  DNA polymerase beta domain protein region  32.98 
 
 		 146 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1691  DNA polymerase beta domain protein region  28.74 
 
 		 95 aa  41.6  0.004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0339005 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0095  DNA polymerase beta subunit  29.47 
 
 		 112 aa  41.6  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.365343 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0347  DNA polymerase beta domain protein region  35.29 
 
 		 102 aa  40.8  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0269  nucleotidyltransferase  30.61 
 
 		 135 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0074  DNA polymerase beta subunit  29.41 
 
 		 167 aa  40.8  0.007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.649799  normal  0.174892 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3505  DNA polymerase beta subunit  30.38 
 
 		 115 aa  40.4  0.007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0882  DNA polymerase beta subunit  34.21 
 
 		 156 aa  40.8  0.007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000293265 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1450  DNA polymerase beta subunit  37.23 
 
 		 115 aa  40.4  0.008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.374866 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2147  DNA polymerase beta domain protein region  29.59 
 
 		 112 aa  40.4  0.008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4035  DNA polymerase beta subunit  27.42 
 
 		 103 aa  40  0.01  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>