20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_2025 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012793  GWCH70_2025  DNA polymerase beta domain protein region  100 
 
 		 82 aa  164  4e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0505934  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1381  DNA polymerase beta domain protein region  74.68 
 
 		 97 aa  122  2e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0295  DNA polymerase beta domain protein region  66.25 
 
 		 98 aa  109  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0284  DNA polymerase beta domain protein region  64.56 
 
 		 99 aa  106  9.000000000000001e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0763  DNA polymerase beta domain protein region  32.53 
 
 		 111 aa  53.1  0.000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.667533  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2573  DNA polymerase beta domain protein region  31.58 
 
 		 97 aa  52  0.000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0668582  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0806  nucleotidyltransferase substrate binding protein, HI0074 family  44 
 
 		 247 aa  50.1  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1475  DNA polymerase beta domain protein region  34.18 
 
 		 100 aa  47.4  0.00007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0547  DNA polymerase beta subunit  45.83 
 
 		 100 aa  45.1  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.790238  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0095  DNA polymerase beta subunit  32.89 
 
 		 112 aa  45.1  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.365343 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2655  DNA polymerase beta subunit  31.51 
 
 		 108 aa  42.7  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.748854  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1133  DNA polymerase beta subunit  36.99 
 
 		 123 aa  42.4  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1560  DNA polymerase beta domain protein region  29.27 
 
 		 105 aa  41.6  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1772  DNA polymerase beta domain protein region  36.84 
 
 		 99 aa  41.6  0.004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0347  DNA polymerase beta domain protein region  38.6 
 
 		 102 aa  41.2  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0028  nucleotidyltransferase family protein  37.74 
 
 		 96 aa  40.8  0.006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.422617  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0063  nucleotidyltransferase domain protein  38.75 
 
 		 128 aa  40.4  0.009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0040  nucleotidyltransferase domain protein  38.75 
 
 		 128 aa  40.4  0.009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000549944 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1757  DNA polymerase, beta-like region  33.85 
 
 		 104 aa  40.4  0.009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.511346  normal  0.1342 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0102  nucleotidyltransferase domain-containing protein  38.75 
 
 		 128 aa  40.4  0.009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0913883  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>