45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_2573 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010718  Nther_2573  DNA polymerase beta domain protein region  100 
 
 
97 aa  194  4.0000000000000005e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0668582  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0806  nucleotidyltransferase substrate binding protein, HI0074 family  38.14 
 
 
247 aa  75.5  0.0000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0051  DNA polymerase beta subunit  44.33 
 
 
97 aa  75.5  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0498801  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1038  DNA polymerase beta subunit  42.27 
 
 
118 aa  74.7  0.0000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0191145  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0763  DNA polymerase beta domain protein region  36.84 
 
 
111 aa  73.2  0.000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.667533  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1475  DNA polymerase beta domain protein region  38 
 
 
100 aa  72.8  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0284  DNA polymerase beta domain protein region  36.84 
 
 
99 aa  72.4  0.000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0295  DNA polymerase beta domain protein region  36.96 
 
 
98 aa  70.1  0.00000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1674  DNA polymerase, beta-like region  38.46 
 
 
105 aa  65.9  0.0000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.538651  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0897  HsdR-like, putative type I restriction deoxyribonuclease  33.67 
 
 
1294 aa  62  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1381  DNA polymerase beta domain protein region  32.61 
 
 
97 aa  62  0.000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2655  DNA polymerase beta subunit  26.32 
 
 
108 aa  61.2  0.000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.748854  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0095  DNA polymerase beta subunit  30.3 
 
 
112 aa  59.3  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.365343 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1560  DNA polymerase beta domain protein region  33.33 
 
 
105 aa  57.8  0.00000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02490  nucleotidyltransferase  31.58 
 
 
103 aa  57.8  0.00000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.456196  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4507  DNA polymerase beta subunit  37.21 
 
 
103 aa  57.4  0.00000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.152779 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1133  DNA polymerase beta subunit  28.57 
 
 
123 aa  57.4  0.00000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0594  hypothetical protein  28.42 
 
 
102 aa  57.4  0.00000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5240  DNA polymerase beta domain protein region  29.47 
 
 
104 aa  57  0.00000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1207  DNA polymerase beta subunit  30 
 
 
105 aa  54.7  0.0000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.901472  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2848  hypothetical protein  27.37 
 
 
108 aa  54.3  0.0000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0347  DNA polymerase beta domain protein region  29.9 
 
 
102 aa  53.5  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2025  DNA polymerase beta domain protein region  31.58 
 
 
82 aa  52  0.000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0505934  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0069  DNA polymerase beta domain protein region  27.27 
 
 
108 aa  50.8  0.000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1656  DNA polymerase beta domain protein region  35 
 
 
103 aa  50.8  0.000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0233  DNA polymerase beta domain protein region  26.26 
 
 
108 aa  48.1  0.00004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1349  DNA polymerase beta domain protein region  33.33 
 
 
96 aa  47.8  0.00005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3062  DNA polymerase beta domain protein region  34.52 
 
 
189 aa  47.4  0.00006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0250  DNA polymerase beta subunit  34.09 
 
 
137 aa  46.6  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0203  DNA polymerase beta subunit  32.63 
 
 
155 aa  45.8  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0491  hypothetical protein  28.28 
 
 
112 aa  45.8  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.484621  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0292  DNA polymerase beta subunit  40.43 
 
 
108 aa  45.8  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0754  DNA polymerase beta domain protein region  28.28 
 
 
106 aa  45.8  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.923157  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1736  hypothetical protein  37.84 
 
 
271 aa  45.4  0.0003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.76389  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0769  DNA polymerase beta domain protein region  28.43 
 
 
106 aa  44.7  0.0004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1422  DNA polymerase beta subunit  38.89 
 
 
123 aa  43.9  0.0008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.747879  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2359  DNA polymerase beta domain protein region  30.53 
 
 
100 aa  43.1  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1691  DNA polymerase beta domain protein region  31.82 
 
 
95 aa  43.1  0.001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.0339005 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0104  DNA polymerase beta domain protein region  33.33 
 
 
114 aa  43.5  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1936  putative nucleotidyltransferase  33.73 
 
 
107 aa  42.4  0.002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0949  DNA polymerase beta subunit  36.99 
 
 
102 aa  41.6  0.004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.878884  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0829  DNA polymerase beta subunit  35.63 
 
 
98 aa  41.6  0.004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.141069  normal  0.412533 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3203  DNA polymerase beta subunit  34.15 
 
 
98 aa  41.2  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0399  DNA polymerase beta subunit  30 
 
 
155 aa  41.2  0.005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1102  hypothetical protein  32.61 
 
 
100 aa  40.8  0.007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.836571  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>