35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_1349 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014150  Bmur_1349  DNA polymerase beta domain protein region  100 
 
 		 96 aa  189  2e-47  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5240  DNA polymerase beta domain protein region  34.38 
 
 		 104 aa  60.5  0.000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0806  nucleotidyltransferase substrate binding protein, HI0074 family  38.95 
 
 		 247 aa  59.3  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0292  DNA polymerase beta subunit  31.96 
 
 		 108 aa  58.2  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0233  DNA polymerase beta domain protein region  31.96 
 
 		 108 aa  58.5  0.00000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1691  DNA polymerase beta domain protein region  36.96 
 
 		 95 aa  57.4  0.00000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0339005 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1560  DNA polymerase beta domain protein region  38.64 
 
 		 105 aa  55.1  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0347  DNA polymerase beta domain protein region  35.79 
 
 		 102 aa  55.1  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0270  nucleotidyltransferase domain-containing protein  32.95 
 
 		 135 aa  54.7  0.0000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.440685  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0095  DNA polymerase beta subunit  33.33 
 
 		 112 aa  54.3  0.0000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.365343 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1936  putative nucleotidyltransferase  39.36 
 
 		 107 aa  54.3  0.0000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1674  DNA polymerase, beta-like region  35.56 
 
 		 105 aa  54.3  0.0000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.538651  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0069  DNA polymerase beta domain protein region  32.58 
 
 		 108 aa  53.5  0.0000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1207  DNA polymerase beta subunit  32.29 
 
 		 105 aa  50.4  0.000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.901472  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0284  DNA polymerase beta domain protein region  40 
 
 		 99 aa  50.1  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0295  DNA polymerase beta domain protein region  40 
 
 		 98 aa  50.1  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1038  DNA polymerase beta subunit  37.63 
 
 		 118 aa  49.3  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0191145  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02490  nucleotidyltransferase  34.02 
 
 		 103 aa  48.5  0.00003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.456196  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2573  DNA polymerase beta domain protein region  33.33 
 
 		 97 aa  47.8  0.00005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0668582  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0763  DNA polymerase beta domain protein region  32.29 
 
 		 111 aa  47.8  0.00006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.667533  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1570  DNA polymerase beta domain protein region  40 
 
 		 102 aa  47.8  0.00006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2655  DNA polymerase beta subunit  30.53 
 
 		 108 aa  47  0.00009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.748854  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3041  DNA polymerase beta subunit  31.07 
 
 		 116 aa  46.6  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0754  DNA polymerase beta domain protein region  36.17 
 
 		 106 aa  45.8  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.923157  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4091  DNA polymerase beta subunit  27.27 
 
 		 121 aa  45.4  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.761535  normal  0.446242 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1133  DNA polymerase beta subunit  32.04 
 
 		 123 aa  45.4  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0769  DNA polymerase beta domain protein region  36.17 
 
 		 106 aa  45.1  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1475  DNA polymerase beta domain protein region  35.87 
 
 		 100 aa  43.9  0.0008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3922  DNA polymerase beta subunit  33.73 
 
 		 117 aa  43.5  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0657046 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4507  DNA polymerase beta subunit  28.09 
 
 		 103 aa  42.7  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.152779 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1656  DNA polymerase beta domain protein region  50 
 
 		 103 aa  43.1  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0491  hypothetical protein  30.77 
 
 		 112 aa  42.4  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.484621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1920  DNA polymerase beta subunit  29.81 
 
 		 116 aa  41.6  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000388354 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1381  DNA polymerase beta domain protein region  32.99 
 
 		 97 aa  41.6  0.004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0825  DNA polymerase beta subunit  26.42 
 
 		 140 aa  41.2  0.004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.453012  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>