69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_3922 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_3922  DNA polymerase beta subunit  100 
 
 		 117 aa  234  3e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0657046 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1450  DNA polymerase beta subunit  63.3 
 
 		 115 aa  145  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.374866 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0997  DNA polymerase beta subunit  48.54 
 
 		 115 aa  102  2e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.995341  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0574  DNA polymerase beta subunit  43.14 
 
 		 120 aa  68.6  0.00000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.412375  normal  0.178688 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0606  DNA polymerase beta domain protein region  40.23 
 
 		 105 aa  67.8  0.00000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000675523 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0083  hypothetical protein  41.84 
 
 		 111 aa  65.1  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.394074  normal  0.26212 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1866  DNA polymerase beta domain protein region  34.62 
 
 		 119 aa  64.7  0.0000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0576  DNA polymerase beta subunit  39.22 
 
 		 121 aa  63.2  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.887062  normal  0.28507 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3846  DNA polymerase beta subunit  40.7 
 
 		 121 aa  63.2  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000154582  unclonable  0.00000693944 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0618  DNA polymerase beta domain protein region  35.35 
 
 		 106 aa  62.8  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.686113  normal  0.81414 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0041  DNA polymerase beta domain protein region  34.58 
 
 		 117 aa  61.6  0.000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4091  DNA polymerase beta subunit  45.12 
 
 		 121 aa  61.2  0.000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.761535  normal  0.446242 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1681  DNA polymerase, beta-like region  31.37 
 
 		 107 aa  58.5  0.00000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.044025  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0499  nucleotidyltransferase domain-containing protein  41.57 
 
 		 102 aa  58.5  0.00000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1028  DNA polymerase beta domain protein region  31.46 
 
 		 111 aa  56.2  0.0000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000129156  normal  0.703188 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4127  hypothetical protein  31.07 
 
 		 191 aa  55.1  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000129079 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2470  DNA polymerase beta subunit  34.29 
 
 		 105 aa  54.7  0.0000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.22963  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1920  DNA polymerase beta subunit  37.04 
 
 		 116 aa  52.8  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000388354 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0354  DNA polymerase beta subunit  34.29 
 
 		 105 aa  52.8  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1691  DNA polymerase beta subunit  48.15 
 
 		 130 aa  52.8  0.000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.0000100624  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3842  DNA polymerase beta subunit  40.43 
 
 		 127 aa  52  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000823006 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0236  DNA polymerase beta subunit  35.29 
 
 		 103 aa  51.2  0.000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2490  DNA polymerase beta domain protein region  30.56 
 
 		 110 aa  51.2  0.000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1772  DNA polymerase beta domain protein region  36.46 
 
 		 99 aa  50.8  0.000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1725  DNA polymerase beta subunit  31.48 
 
 		 111 aa  50.4  0.000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000013917  n/a   
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0037  nucleotidyltransferase domain-containing protein  34.58 
 
 		 132 aa  50.4  0.000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3041  DNA polymerase beta subunit  31.68 
 
 		 116 aa  50.1  0.000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011774  BCG9842_A0076  nucleotidyltransferase domain protein  30.91 
 
 		 110 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.467951  normal  0.54284 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2718  DNA polymerase, beta-like region  30.77 
 
 		 109 aa  49.7  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000888869  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4420  DNA polymerase beta subunit  36.08 
 
 		 118 aa  48.9  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.478946  normal  0.142305 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0063  nucleotidyltransferase domain protein  33.33 
 
 		 128 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0040  nucleotidyltransferase domain protein  33.33 
 
 		 128 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000549944 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0102  nucleotidyltransferase domain-containing protein  33.33 
 
 		 128 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0913883  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1577  DNA polymerase, beta-like region  27.37 
 
 		 104 aa  48.1  0.00004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000241752  normal  0.133279 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1028  DNA polymerase beta subunit  44.07 
 
 		 94 aa  48.1  0.00004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.261092  normal  0.357302 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0317  DNA polymerase beta domain protein region  30.77 
 
 		 121 aa  47.4  0.00007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1748  DNA polymerase beta subunit  25 
 
 		 112 aa  47  0.00008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000372139  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1301  DNA polymerase beta subunit  32.93 
 
 		 111 aa  46.2  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.232434  normal  0.452159 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0216  hypothetical protein  29.21 
 
 		 103 aa  46.6  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0242312  hitchhiker  0.0000000000000575833 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2147  DNA polymerase beta domain protein region  29.63 
 
 		 112 aa  46.6  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1536  hypothetical protein  34.67 
 
 		 81 aa  45.8  0.0002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.851535  normal  0.0721656 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0170  DNA polymerase beta subunit  34.62 
 
 		 95 aa  45.4  0.0003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4057  DNA polymerase beta domain protein region  32.97 
 
 		 101 aa  43.9  0.0007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0251  DNA polymerase beta subunit  33.71 
 
 		 110 aa  43.9  0.0008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0736042  normal  0.344396 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0347  DNA polymerase beta domain protein region  31.93 
 
 		 102 aa  43.5  0.0009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2432  DNA polymerase beta subunit  27.88 
 
 		 111 aa  43.5  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.71469  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3858  DNA polymerase beta domain protein region  27.36 
 
 		 103 aa  43.1  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0908144  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2571  DNA polymerase beta domain protein region  33.03 
 
 		 126 aa  43.5  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.373399  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1349  DNA polymerase beta domain protein region  33.73 
 
 		 96 aa  43.5  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0706  DNA polymerase beta subunit  37.76 
 
 		 119 aa  43.5  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00655173 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1619  DNA polymerase beta domain-containing protein region  30.95 
 
 		 105 aa  42.4  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.316623  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2347  DNA polymerase beta subunit  32.38 
 
 		 116 aa  42.7  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.048778  normal  0.250853 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2191  DNA polymerase beta subunit  31.71 
 
 		 111 aa  42.4  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.190588  normal  0.488652 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1020  DNA polymerase beta subunit  31.96 
 
 		 106 aa  42.7  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26330  predicted nucleotidyltransferase  43.1 
 
 		 121 aa  41.6  0.003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.155672  normal  0.055633 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2615  DNA polymerase beta subunit  28.42 
 
 		 195 aa  42  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.506514  normal  0.0510048 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0897  DNA polymerase beta subunit  24.32 
 
 		 123 aa  42  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2162  DNA polymerase beta subunit  30.67 
 
 		 114 aa  42  0.003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0365  DNA polymerase beta subunit  45.45 
 
 		 113 aa  41.2  0.005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.200117 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3011  DNA polymerase beta subunit  33.33 
 
 		 107 aa  41.2  0.005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.303022  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1359  nucleotidyltransferase, putative  31.97 
 
 		 134 aa  40.8  0.006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3225  nucleotidyltransferase domain-containing protein  30.77 
 
 		 166 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00907014  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4067  DNA polymerase beta domain protein region  36.05 
 
 		 110 aa  40.8  0.007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0515  DNA polymerase beta domain protein region  30.28 
 
 		 108 aa  40.4  0.007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0793119  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1672  DNA polymerase beta domain protein region  29.13 
 
 		 146 aa  40.4  0.008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1803  DNA polymerase beta domain protein region  45.83 
 
 		 96 aa  40.4  0.008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1252  DNA polymerase beta subunit  36.71 
 
 		 108 aa  40.4  0.008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000815362  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0175  DNA polymerase beta subunit  34.92 
 
 		 121 aa  40.4  0.009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.193689 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1363  nucleotidyltransferase, putative  32.73 
 
 		 134 aa  40  0.01  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  decreased coverage  0.00238094  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>