20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_4057 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013216  Dtox_4057  DNA polymerase beta domain protein region  100 
 
 
101 aa  202  9e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1655  DNA polymerase beta domain protein region  53.85 
 
 
128 aa  84.7  4e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3858  DNA polymerase beta domain protein region  38.64 
 
 
103 aa  64.3  0.0000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0908144  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1252  DNA polymerase beta subunit  43.94 
 
 
108 aa  62.4  0.000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000815362  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2738  DNA polymerase beta domain protein region  36.56 
 
 
109 aa  59.7  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.474404 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1064  hypothetical protein  54.35 
 
 
53 aa  59.3  0.00000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.162255  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4067  DNA polymerase beta domain protein region  39.02 
 
 
110 aa  56.2  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3011  DNA polymerase beta subunit  32.58 
 
 
107 aa  52.8  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.303022  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13820  Nucleotidyltransferase domain protein  38.16 
 
 
85 aa  48.5  0.00003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0897  DNA polymerase beta subunit  34.02 
 
 
123 aa  45.8  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1067  DNA polymerase beta subunit  41.18 
 
 
108 aa  43.9  0.0007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.485724  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3922  DNA polymerase beta subunit  32.97 
 
 
117 aa  43.9  0.0007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0657046 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1397  DNA polymerase, beta-like region  38.46 
 
 
113 aa  43.1  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0618  DNA polymerase beta domain protein region  28.04 
 
 
106 aa  43.1  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.686113  normal  0.81414 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0758  DNA polymerase beta subunit  32.26 
 
 
136 aa  43.5  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.258998  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3165  hypothetical protein  30.67 
 
 
139 aa  42.4  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4026  DNA polymerase beta domain protein region  32.88 
 
 
82 aa  41.6  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1450  DNA polymerase beta subunit  32.22 
 
 
115 aa  41.6  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.374866 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2345  DNA polymerase beta domain protein region  44.68 
 
 
144 aa  40.4  0.009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0323  DNA polymerase beta subunit  35.53 
 
 
116 aa  40.4  0.009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.103671  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>