29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_0758 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_0758  DNA polymerase beta subunit  100 
 
 		 136 aa  278  2e-74  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.258998  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1792  hypothetical protein  48.72 
 
 		 295 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.210053 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1762  hypothetical protein  48.72 
 
 		 276 aa  117  3.9999999999999996e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.254099  normal  0.270022 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1440  hypothetical protein  48.67 
 
 		 252 aa  111  4.0000000000000004e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3044  hypothetical protein  42.48 
 
 		 129 aa  93.2  9e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.137112  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0760  DNA polymerase beta subunit  38.93 
 
 		 133 aa  92.8  1e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0261005  normal  0.995846 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2195  DNA polymerase beta domain protein region  30.93 
 
 		 145 aa  54.3  0.0000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000295232  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0074  DNA polymerase beta subunit  24.59 
 
 		 167 aa  50.4  0.000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.649799  normal  0.174892 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0209  hypothetical protein  26.61 
 
 		 142 aa  48.1  0.00003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.184699  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1105  DNA polymerase beta subunit  24.17 
 
 		 162 aa  48.5  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00137564  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0769  DNA polymerase beta subunit  30.36 
 
 		 140 aa  48.1  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.452444 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1678  DNA polymerase beta subunit  26.47 
 
 		 153 aa  48.1  0.00004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000143849  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0545  DNA polymerase beta domain protein region  30.48 
 
 		 135 aa  47.4  0.00007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00116753  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2244  DNA polymerase beta subunit  23.68 
 
 		 146 aa  44.7  0.0004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.521292  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1370  DNA polymerase beta subunit  29.36 
 
 		 241 aa  44.7  0.0005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0334218 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1672  DNA polymerase beta domain protein region  31.07 
 
 		 146 aa  43.9  0.0007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0225  DNA polymerase beta domain protein region  27.45 
 
 		 142 aa  43.9  0.0008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0882  DNA polymerase beta subunit  26.6 
 
 		 156 aa  42.7  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000293265 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4057  DNA polymerase beta domain protein region  32.26 
 
 		 101 aa  43.5  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1422  DNA polymerase beta subunit  28.57 
 
 		 123 aa  43.1  0.001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.747879  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2352  DNA polymerase, beta-like region  26.92 
 
 		 148 aa  42.7  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00951181  normal  0.0970434 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3165  hypothetical protein  29.27 
 
 		 139 aa  43.1  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1668  DNA polymerase beta domain protein region  28.97 
 
 		 146 aa  42.4  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4000  DNA polymerase beta domain protein region  25.62 
 
 		 145 aa  42.4  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0250  DNA polymerase beta subunit  30.1 
 
 		 137 aa  41.6  0.003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3858  DNA polymerase beta domain protein region  34.15 
 
 		 103 aa  41.6  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0908144  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2714  DNA polymerase, beta-like region  58.62 
 
 		 110 aa  41.2  0.005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.505964  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1972  DNA polymerase beta domain protein region  30.61 
 
 		 131 aa  40.4  0.008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.18731 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1655  DNA polymerase beta domain protein region  44 
 
 		 128 aa  40.4  0.009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>