25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_4000 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013216  Dtox_4000  DNA polymerase beta domain protein region  100 
 
 		 145 aa  289  7e-78  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1678  DNA polymerase beta subunit  32.35 
 
 		 153 aa  73.6  0.0000000000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000143849  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0882  DNA polymerase beta subunit  33.33 
 
 		 156 aa  56.6  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000293265 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1736  hypothetical protein  30.17 
 
 		 271 aa  56.2  0.0000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.76389  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0328  hypothetical protein  41.27 
 
 		 72 aa  55.8  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0074  DNA polymerase beta subunit  28.3 
 
 		 167 aa  54.3  0.0000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.649799  normal  0.174892 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1672  DNA polymerase beta domain protein region  34.21 
 
 		 146 aa  52.8  0.000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1105  DNA polymerase beta subunit  31.58 
 
 		 162 aa  52  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00137564  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0825  DNA polymerase beta subunit  28.57 
 
 		 140 aa  50.4  0.000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.453012  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0545  DNA polymerase beta domain protein region  28.71 
 
 		 135 aa  50.4  0.000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00116753  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0760  DNA polymerase beta subunit  24.17 
 
 		 133 aa  48.5  0.00003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0261005  normal  0.995846 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2195  DNA polymerase beta domain protein region  31.09 
 
 		 145 aa  48.1  0.00004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000295232  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0769  DNA polymerase beta subunit  30.51 
 
 		 140 aa  47.8  0.00005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.452444 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1769  hypothetical protein  28.95 
 
 		 292 aa  46.2  0.0002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.026632  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2954  DNA polymerase beta subunit  28.69 
 
 		 133 aa  43.9  0.0008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2567  DNA polymerase beta domain protein region  24.8 
 
 		 141 aa  43.5  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0758  DNA polymerase beta subunit  25.62 
 
 		 136 aa  42.4  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.258998  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4418  DNA polymerase beta subunit  25.76 
 
 		 148 aa  42.4  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.234666 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0250  DNA polymerase beta subunit  31.87 
 
 		 137 aa  42  0.003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0364  DNA polymerase beta subunit  33.64 
 
 		 148 aa  42  0.003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3257  DNA polymerase, beta-like region  26.15 
 
 		 132 aa  41.6  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00329127  hitchhiker  2.42256e-16 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0763  DNA polymerase beta subunit  25 
 
 		 143 aa  42  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.122769 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2558  DNA polymerase beta domain protein region  23.85 
 
 		 157 aa  41.6  0.004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0178  DNA polymerase, beta-like region  30.49 
 
 		 163 aa  40.8  0.006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0107452  normal  0.933077 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2563  DNA polymerase beta domain protein region  23.85 
 
 		 133 aa  40  0.01  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>