50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_0545 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011661  Dtur_0545  DNA polymerase beta domain protein region  100 
 
 		 135 aa  259  8.999999999999999e-69  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00116753  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0074  DNA polymerase beta subunit  27.97 
 
 		 167 aa  62.8  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.649799  normal  0.174892 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0825  DNA polymerase beta subunit  32.23 
 
 		 140 aa  62.4  0.000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.453012  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2195  DNA polymerase beta domain protein region  33.9 
 
 		 145 aa  62.4  0.000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000295232  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0364  DNA polymerase beta subunit  31.09 
 
 		 148 aa  61.6  0.000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1736  hypothetical protein  31.53 
 
 		 271 aa  60.5  0.000000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.76389  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2165  DNA polymerase beta subunit  31.06 
 
 		 151 aa  58.2  0.00000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2352  DNA polymerase, beta-like region  30.34 
 
 		 148 aa  57.8  0.00000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00951181  normal  0.0970434 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2563  DNA polymerase beta domain protein region  30.25 
 
 		 133 aa  56.2  0.0000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0769  DNA polymerase beta subunit  27.73 
 
 		 140 aa  56.2  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.452444 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0763  DNA polymerase beta subunit  31.4 
 
 		 143 aa  55.5  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.122769 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0680  DNA polymerase beta subunit  30.71 
 
 		 145 aa  54.7  0.0000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.244099  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0209  hypothetical protein  27.05 
 
 		 142 aa  55.1  0.0000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.184699  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2558  DNA polymerase beta domain protein region  31.9 
 
 		 157 aa  54.7  0.0000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0178  DNA polymerase, beta-like region  29.6 
 
 		 163 aa  53.9  0.0000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0107452  normal  0.933077 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4418  DNA polymerase beta subunit  31.4 
 
 		 148 aa  53.5  0.0000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.234666 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1370  DNA polymerase beta subunit  29.09 
 
 		 241 aa  52.8  0.000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0334218 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0372  DNA polymerase beta subunit  28.57 
 
 		 141 aa  51.6  0.000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000034054  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1312  hypothetical protein  28.79 
 
 		 198 aa  50.8  0.000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1678  DNA polymerase beta subunit  26.09 
 
 		 153 aa  50.4  0.000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000143849  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4000  DNA polymerase beta domain protein region  28.71 
 
 		 145 aa  50.4  0.000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1588  hypothetical protein  34.45 
 
 		 146 aa  50.1  0.00001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0392  hypothetical protein  29.32 
 
 		 143 aa  49.7  0.00001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.345138  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1105  DNA polymerase beta subunit  26.32 
 
 		 162 aa  47.8  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00137564  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2954  DNA polymerase beta subunit  24.79 
 
 		 133 aa  47.4  0.00007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1762  hypothetical protein  28.85 
 
 		 276 aa  47.4  0.00007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.254099  normal  0.270022 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0758  DNA polymerase beta subunit  30.48 
 
 		 136 aa  47.4  0.00007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.258998  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0250  DNA polymerase beta subunit  30 
 
 		 137 aa  47  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2244  DNA polymerase beta subunit  28.3 
 
 		 146 aa  46.6  0.0001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.521292  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0658  DNA polymerase beta subunit  31.07 
 
 		 137 aa  46.6  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000311195  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1672  DNA polymerase beta domain protein region  29.46 
 
 		 146 aa  46.6  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2281  nucleotidyltransferase  28 
 
 		 132 aa  46.6  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0106509  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2567  DNA polymerase beta domain protein region  29.6 
 
 		 141 aa  46.2  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0882  DNA polymerase beta subunit  27.27 
 
 		 156 aa  45.8  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000293265 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2345  DNA polymerase beta domain protein region  31.15 
 
 		 144 aa  45.8  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3257  DNA polymerase, beta-like region  30.19 
 
 		 132 aa  45.8  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00329127  hitchhiker  2.42256e-16 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1792  hypothetical protein  26.92 
 
 		 295 aa  44.7  0.0005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.210053 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1440  hypothetical protein  28.71 
 
 		 252 aa  43.9  0.0008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1316  nucleotidyltransferase  29.41 
 
 		 148 aa  43.5  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0225  DNA polymerase beta domain protein region  31.58 
 
 		 142 aa  42.4  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1422  DNA polymerase beta subunit  27.52 
 
 		 123 aa  42.4  0.002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.747879  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1404  DNA polymerase, beta-like region  32.71 
 
 		 132 aa  42.4  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.304011  normal  0.205186 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0428  DNA polymerase, beta-like region  28.69 
 
 		 153 aa  42.7  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0480568  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3044  hypothetical protein  27.91 
 
 		 129 aa  42  0.003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.137112  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1999  DNA polymerase beta domain protein region  28.1 
 
 		 155 aa  41.6  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.95495  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0893  DNA polymerase beta domain-containing protein region  28.95 
 
 		 143 aa  41.6  0.004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1223  DNA polymerase beta domain protein region  28.26 
 
 		 143 aa  40.8  0.006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0545  DNA polymerase beta subunit  27.78 
 
 		 128 aa  40.4  0.008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00745715  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0760  DNA polymerase beta subunit  22.12 
 
 		 133 aa  40.4  0.008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0261005  normal  0.995846 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0328  hypothetical protein  38.78 
 
 		 72 aa  40  0.009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>