13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_1223 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013158  Huta_1223  DNA polymerase beta domain protein region  100 
 
 		 143 aa  288  2e-77  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0129  DNA polymerase beta domain protein region  36.44 
 
 		 147 aa  68.6  0.00000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  hitchhiker  0.00283824  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3253  DNA polymerase beta domain protein region  29.46 
 
 		 132 aa  49.7  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2332  DNA polymerase beta subunit  33.98 
 
 		 128 aa  49.3  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1735  DNA polymerase beta domain protein region  43.82 
 
 		 106 aa  47.8  0.00006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1736  hypothetical protein  30 
 
 		 271 aa  42.7  0.002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.76389  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0755  DNA polymerase beta subunit  38.24 
 
 		 123 aa  42.4  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0221  hypothetical protein  44.44 
 
 		 112 aa  41.2  0.004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2946  DNA polymerase beta subunit  33.33 
 
 		 131 aa  41.2  0.004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2567  DNA polymerase beta domain protein region  31.08 
 
 		 141 aa  41.6  0.004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1972  DNA polymerase beta domain protein region  28.46 
 
 		 131 aa  40.8  0.006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.18731 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0545  DNA polymerase beta domain protein region  28.26 
 
 		 135 aa  40.8  0.006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00116753  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0133  DNA polymerase beta subunit  30.71 
 
 		 131 aa  40.8  0.007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>