50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_0769 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_0769  DNA polymerase beta subunit  100 
 
 		 140 aa  281  2.0000000000000002e-75  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.452444 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2195  DNA polymerase beta domain protein region  35.65 
 
 		 145 aa  78.6  0.00000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000295232  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0364  DNA polymerase beta subunit  36.19 
 
 		 148 aa  74.3  0.0000000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2244  DNA polymerase beta subunit  33.67 
 
 		 146 aa  70.1  0.00000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.521292  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3257  DNA polymerase, beta-like region  32 
 
 		 132 aa  69.3  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00329127  hitchhiker  2.42256e-16 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1736  hypothetical protein  37.5 
 
 		 271 aa  67  0.00000000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.76389  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1672  DNA polymerase beta domain protein region  29.01 
 
 		 146 aa  66.2  0.0000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2563  DNA polymerase beta domain protein region  33.63 
 
 		 133 aa  66.6  0.0000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0825  DNA polymerase beta subunit  37.72 
 
 		 140 aa  65.9  0.0000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.453012  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2558  DNA polymerase beta domain protein region  33.63 
 
 		 157 aa  65.5  0.0000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0178  DNA polymerase, beta-like region  32.26 
 
 		 163 aa  64.3  0.0000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0107452  normal  0.933077 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0658  DNA polymerase beta subunit  31.19 
 
 		 137 aa  59.7  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000311195  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1105  DNA polymerase beta subunit  34.91 
 
 		 162 aa  60.1  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00137564  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2352  DNA polymerase, beta-like region  29.23 
 
 		 148 aa  59.7  0.00000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00951181  normal  0.0970434 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0882  DNA polymerase beta subunit  35.83 
 
 		 156 aa  58.9  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000293265 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1370  DNA polymerase beta subunit  36.52 
 
 		 241 aa  58.9  0.00000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0334218 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0129  DNA polymerase beta domain protein region  32.85 
 
 		 147 aa  58.5  0.00000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  hitchhiker  0.00283824  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0074  DNA polymerase beta subunit  30.77 
 
 		 167 aa  57.8  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.649799  normal  0.174892 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0225  DNA polymerase beta domain protein region  31.48 
 
 		 142 aa  57.4  0.00000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0250  DNA polymerase beta subunit  38.6 
 
 		 137 aa  57  0.00000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0545  DNA polymerase beta domain protein region  27.73 
 
 		 135 aa  56.2  0.0000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00116753  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0763  DNA polymerase beta subunit  30.3 
 
 		 143 aa  56.6  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.122769 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0372  DNA polymerase beta subunit  30.43 
 
 		 141 aa  55.5  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000034054  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1668  DNA polymerase beta domain protein region  29.13 
 
 		 146 aa  54.3  0.0000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4418  DNA polymerase beta subunit  28.79 
 
 		 148 aa  53.1  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.234666 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1563  DNA polymerase beta domain protein region  33.06 
 
 		 152 aa  52.8  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2954  DNA polymerase beta subunit  35.34 
 
 		 133 aa  52  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2567  DNA polymerase beta domain protein region  24.24 
 
 		 141 aa  52  0.000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0758  DNA polymerase beta subunit  30.36 
 
 		 136 aa  48.1  0.00003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.258998  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2165  DNA polymerase beta subunit  26.96 
 
 		 151 aa  48.1  0.00004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2281  nucleotidyltransferase  31.25 
 
 		 132 aa  48.1  0.00004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0106509  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1678  DNA polymerase beta subunit  25.89 
 
 		 153 aa  48.1  0.00004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000143849  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1316  nucleotidyltransferase  32.35 
 
 		 148 aa  47.8  0.00005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4000  DNA polymerase beta domain protein region  30.51 
 
 		 145 aa  47.8  0.00005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1422  DNA polymerase beta subunit  32.71 
 
 		 123 aa  47.8  0.00005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.747879  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1588  hypothetical protein  26.05 
 
 		 146 aa  47.4  0.00006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3044  hypothetical protein  30 
 
 		 129 aa  47.4  0.00008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.137112  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3165  hypothetical protein  36.26 
 
 		 139 aa  45.1  0.0003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1769  hypothetical protein  33.94 
 
 		 292 aa  45.1  0.0004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.026632  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2734  DNA polymerase beta domain protein region  34.82 
 
 		 144 aa  44.3  0.0006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.174135  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4528  DNA polymerase beta subunit  29.37 
 
 		 152 aa  44.3  0.0006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.373361  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1861  DNA polymerase beta subunit  27.87 
 
 		 140 aa  43.9  0.0008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1900  hypothetical protein  32.5 
 
 		 250 aa  42.7  0.001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0545  DNA polymerase beta subunit  32.67 
 
 		 128 aa  42.4  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00745715  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0209  hypothetical protein  28.85 
 
 		 142 aa  42.4  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.184699  n/a   
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4484  DNA polymerase beta domain protein region  27.97 
 
 		 146 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1999  DNA polymerase beta domain protein region  28.93 
 
 		 155 aa  42.4  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.95495  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3253  DNA polymerase beta domain protein region  28 
 
 		 132 aa  42  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1792  hypothetical protein  28.71 
 
 		 295 aa  41.6  0.004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.210053 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0943  DNA polymerase beta subunit  35.85 
 
 		 136 aa  40.8  0.007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.31536  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>