53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_0618 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014212  Mesil_0618  DNA polymerase beta domain protein region  100 
 
 		 106 aa  211  2.9999999999999995e-54  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.686113  normal  0.81414 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0606  DNA polymerase beta domain protein region  49.5 
 
 		 105 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000675523 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0216  hypothetical protein  41.58 
 
 		 103 aa  88.2  3e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0242312  hitchhiker  0.0000000000000575833 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1748  DNA polymerase beta subunit  37.62 
 
 		 112 aa  82.4  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000372139  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3846  DNA polymerase beta subunit  39.42 
 
 		 121 aa  78.2  0.00000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000154582  unclonable  0.00000693944 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0576  DNA polymerase beta subunit  37.62 
 
 		 121 aa  72  0.000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.887062  normal  0.28507 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0574  DNA polymerase beta subunit  37.62 
 
 		 120 aa  65.5  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.412375  normal  0.178688 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3922  DNA polymerase beta subunit  35.35 
 
 		 117 aa  62.8  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0657046 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0083  hypothetical protein  33.66 
 
 		 111 aa  59.3  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.394074  normal  0.26212 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2147  DNA polymerase beta domain protein region  42.11 
 
 		 112 aa  57.4  0.00000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0997  DNA polymerase beta subunit  32 
 
 		 115 aa  57.4  0.00000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.995341  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2669  DNA polymerase beta domain protein region  32.38 
 
 		 110 aa  55.8  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0236  DNA polymerase beta subunit  32.04 
 
 		 103 aa  54.3  0.0000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3842  DNA polymerase beta subunit  43.48 
 
 		 127 aa  53.5  0.0000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000823006 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1577  DNA polymerase, beta-like region  31.25 
 
 		 104 aa  53.1  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000241752  normal  0.133279 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3962  DNA polymerase beta domain protein region  32 
 
 		 105 aa  52.4  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4091  DNA polymerase beta subunit  31.63 
 
 		 121 aa  51.2  0.000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.761535  normal  0.446242 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1450  DNA polymerase beta subunit  30 
 
 		 115 aa  50.8  0.000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.374866 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0102  nucleotidyltransferase domain-containing protein  31.43 
 
 		 128 aa  50.4  0.000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0913883  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0063  nucleotidyltransferase domain protein  31.43 
 
 		 128 aa  50.4  0.000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0040  nucleotidyltransferase domain protein  31.43 
 
 		 128 aa  50.4  0.000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000549944 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2571  DNA polymerase beta domain protein region  42.17 
 
 		 126 aa  50.4  0.000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.373399  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2432  DNA polymerase beta subunit  29.25 
 
 		 111 aa  50.4  0.000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.71469  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3858  DNA polymerase beta domain protein region  39.71 
 
 		 103 aa  49.7  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0908144  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3233  nucleotidyltransferase domain protein  31.37 
 
 		 166 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.73519  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1619  DNA polymerase beta domain-containing protein region  36.36 
 
 		 105 aa  49.3  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.316623  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0499  nucleotidyltransferase domain-containing protein  25.74 
 
 		 102 aa  48.1  0.00004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4127  hypothetical protein  30.12 
 
 		 191 aa  48.1  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000129079 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1617  DNA polymerase beta domain-containing protein region  35.92 
 
 		 103 aa  48.1  0.00004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.450393  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2718  DNA polymerase, beta-like region  33.73 
 
 		 109 aa  47.4  0.00006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000888869  normal  1 
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0037  nucleotidyltransferase domain-containing protein  31.07 
 
 		 132 aa  47  0.00009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011774  BCG9842_A0076  nucleotidyltransferase domain protein  30.77 
 
 		 110 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.467951  normal  0.54284 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3225  nucleotidyltransferase domain-containing protein  30.39 
 
 		 166 aa  45.4  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00907014  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1920  DNA polymerase beta subunit  31.07 
 
 		 116 aa  46.2  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000388354 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2347  DNA polymerase beta subunit  31.19 
 
 		 116 aa  45.8  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.048778  normal  0.250853 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3041  DNA polymerase beta subunit  31.07 
 
 		 116 aa  46.2  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0737  nucleotidyltransferase  57.14 
 
 		 107 aa  43.5  0.0009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4057  DNA polymerase beta domain protein region  28.04 
 
 		 101 aa  43.1  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1691  DNA polymerase beta subunit  33.33 
 
 		 130 aa  43.5  0.001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.0000100624  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4067  DNA polymerase beta domain protein region  27.16 
 
 		 110 aa  42.4  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2615  DNA polymerase beta subunit  30.39 
 
 		 195 aa  42.4  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.506514  normal  0.0510048 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3070  DNA polymerase, beta-like region  48.72 
 
 		 116 aa  42  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.531751 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1028  DNA polymerase beta domain protein region  25.23 
 
 		 111 aa  42  0.003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000129156  normal  0.703188 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2641  DNA polymerase beta domain protein region  29 
 
 		 125 aa  41.6  0.003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2470  DNA polymerase beta subunit  30.77 
 
 		 105 aa  41.2  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.22963  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0354  DNA polymerase beta subunit  32.05 
 
 		 105 aa  41.2  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1020  DNA polymerase beta subunit  28.43 
 
 		 106 aa  41.2  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0551  DNA polymerase beta domain protein region  43.64 
 
 		 106 aa  40.8  0.006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3011  DNA polymerase beta subunit  25.93 
 
 		 107 aa  40.8  0.006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.303022  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1725  DNA polymerase beta subunit  28.04 
 
 		 111 aa  40.8  0.007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000013917  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2529  DNA polymerase beta subunit  45 
 
 		 104 aa  40.4  0.008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0400211 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0365  DNA polymerase beta subunit  37.18 
 
 		 113 aa  40.4  0.008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.200117 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1295  DNA polymerase beta domain protein region  38.78 
 
 		 99 aa  40  0.01  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.599396  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>