29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_3070 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007796  Mhun_3070  DNA polymerase, beta-like region  100 
 
 		 116 aa  233  9e-61  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.531751 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1405  hypothetical protein  38.24 
 
 		 117 aa  68.2  0.00000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.11002 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1577  DNA polymerase, beta-like region  52.38 
 
 		 104 aa  49.7  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000241752  normal  0.133279 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0018  DNA polymerase beta domain protein region  35.96 
 
 		 117 aa  49.3  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.21199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4127  hypothetical protein  25 
 
 		 191 aa  48.9  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000129079 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2147  DNA polymerase beta domain protein region  34.78 
 
 		 112 aa  47.8  0.00005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2571  DNA polymerase beta domain protein region  36.92 
 
 		 126 aa  47  0.00008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.373399  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1397  DNA polymerase, beta-like region  34.85 
 
 		 113 aa  46.6  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4420  DNA polymerase beta subunit  45.1 
 
 		 118 aa  45.4  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.478946  normal  0.142305 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0104  DNA polymerase beta domain protein region  37.31 
 
 		 114 aa  45.4  0.0002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1277  DNA polymerase beta subunit  26.44 
 
 		 111 aa  45.8  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1920  DNA polymerase beta subunit  36.78 
 
 		 116 aa  45.4  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000388354 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4164  DNA polymerase beta domain protein region  38.64 
 
 		 113 aa  44.7  0.0005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3091  DNA polymerase, beta-like region  31.18 
 
 		 111 aa  44.3  0.0006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.304644 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0399  DNA polymerase beta subunit  26.53 
 
 		 155 aa  44.3  0.0006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3919  DNA polymerase beta subunit  28.18 
 
 		 117 aa  42.4  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.935838  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0618  DNA polymerase beta domain protein region  48.72 
 
 		 106 aa  42  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.686113  normal  0.81414 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3226  DNA polymerase beta subunit  27.52 
 
 		 109 aa  42  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.082492 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2850  DNA polymerase beta domain protein region  31.82 
 
 		 111 aa  42  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.787876  normal  0.338784 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1200  DNA polymerase beta subunit  26.74 
 
 		 111 aa  41.6  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.504672  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2316  DNA polymerase beta domain protein region  44.12 
 
 		 155 aa  41.2  0.005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.763015  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1252  DNA polymerase beta subunit  43.18 
 
 		 108 aa  41.2  0.005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000815362  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1691  DNA polymerase beta domain protein region  30.49 
 
 		 101 aa  41.2  0.005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0317  DNA polymerase beta domain protein region  32.08 
 
 		 121 aa  40.8  0.006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0145  hypothetical protein  26.32 
 
 		 131 aa  40.8  0.006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.345001  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1044  DNA polymerase beta subunit  64.29 
 
 		 122 aa  40.8  0.006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0500  DNA polymerase beta subunit  30.26 
 
 		 110 aa  40.8  0.007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000767476  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3436  DNA polymerase beta subunit  32.43 
 
 		 107 aa  40.4  0.008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.212553 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0862  DNA polymerase beta domain protein region  28.57 
 
 		 101 aa  40  0.01  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000634599  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>