16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_3919 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_3919  DNA polymerase beta subunit  100 
 
 		 117 aa  236  5.999999999999999e-62  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.935838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3226  DNA polymerase beta subunit  76.15 
 
 		 109 aa  177  5.999999999999999e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.082492 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0500  DNA polymerase beta domain protein region  48.15 
 
 		 135 aa  114  6e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2746  DNA polymerase beta domain protein region  45.05 
 
 		 122 aa  100  6e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3228  hypothetical protein  50 
 
 		 206 aa  91.7  3e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0857934 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3917  hypothetical protein  49.07 
 
 		 214 aa  87.4  6e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0922453  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0706  DNA polymerase beta subunit  38.2 
 
 		 119 aa  59.7  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00655173 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2571  DNA polymerase beta domain protein region  46.27 
 
 		 126 aa  58.9  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.373399  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0317  DNA polymerase beta domain protein region  29.35 
 
 		 121 aa  58.2  0.00000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4420  DNA polymerase beta subunit  39.08 
 
 		 118 aa  57.4  0.00000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.478946  normal  0.142305 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0041  DNA polymerase beta domain protein region  36.05 
 
 		 117 aa  53.5  0.000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0515  DNA polymerase beta domain protein region  27.78 
 
 		 108 aa  46.2  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0793119  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4127  hypothetical protein  33.68 
 
 		 191 aa  45.1  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000129079 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3070  DNA polymerase, beta-like region  28.18 
 
 		 116 aa  42.4  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.531751 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1866  DNA polymerase beta domain protein region  32.94 
 
 		 119 aa  41.6  0.003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0606  DNA polymerase beta domain protein region  30.56 
 
 		 105 aa  40.4  0.008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000675523 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>