29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_1866 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013385  Adeg_1866  DNA polymerase beta domain protein region  100 
 
 		 119 aa  232  1.0000000000000001e-60  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4091  DNA polymerase beta subunit  44.79 
 
 		 121 aa  78.2  0.00000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.761535  normal  0.446242 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1450  DNA polymerase beta subunit  40.19 
 
 		 115 aa  72.8  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.374866 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3922  DNA polymerase beta subunit  34.62 
 
 		 117 aa  64.7  0.0000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0657046 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0041  DNA polymerase beta domain protein region  36.19 
 
 		 117 aa  59.7  0.00000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0997  DNA polymerase beta subunit  32.63 
 
 		 115 aa  55.8  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.995341  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1028  DNA polymerase beta domain protein region  35.71 
 
 		 111 aa  55.5  0.0000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000129156  normal  0.703188 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4127  hypothetical protein  35.29 
 
 		 191 aa  55.1  0.0000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000129079 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0574  DNA polymerase beta subunit  38.1 
 
 		 120 aa  52.4  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.412375  normal  0.178688 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0576  DNA polymerase beta subunit  37.65 
 
 		 121 aa  52.4  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.887062  normal  0.28507 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1920  DNA polymerase beta subunit  31.07 
 
 		 116 aa  49.3  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000388354 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2571  DNA polymerase beta domain protein region  32.11 
 
 		 126 aa  48.1  0.00004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.373399  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3041  DNA polymerase beta subunit  32.94 
 
 		 116 aa  48.1  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4420  DNA polymerase beta subunit  36.25 
 
 		 118 aa  44.7  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.478946  normal  0.142305 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2347  DNA polymerase beta subunit  33.33 
 
 		 116 aa  44.3  0.0005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.048778  normal  0.250853 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3846  DNA polymerase beta subunit  32.94 
 
 		 121 aa  43.1  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000154582  unclonable  0.00000693944 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0500  DNA polymerase beta domain protein region  37.65 
 
 		 135 aa  43.1  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0871  DNA polymerase beta domain protein region  34.18 
 
 		 99 aa  42.4  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0606  DNA polymerase beta domain protein region  30.49 
 
 		 105 aa  42.4  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000675523 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0274  hypothetical protein  37.04 
 
 		 112 aa  42  0.003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2416  DNA polymerase beta subunit  29.79 
 
 		 103 aa  41.6  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.606985  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3919  DNA polymerase beta subunit  32.94 
 
 		 117 aa  41.6  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.935838  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1359  nucleotidyltransferase, putative  31.4 
 
 		 134 aa  40.8  0.006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1363  nucleotidyltransferase, putative  31.4 
 
 		 134 aa  40.8  0.006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  decreased coverage  0.00238094  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1725  DNA polymerase beta subunit  33.33 
 
 		 111 aa  40.8  0.006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000013917  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0515  DNA polymerase beta domain protein region  33.91 
 
 		 108 aa  40.8  0.006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0793119  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0236  DNA polymerase beta subunit  30.12 
 
 		 103 aa  40.8  0.006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1067  DNA polymerase beta subunit  31.51 
 
 		 108 aa  40.8  0.006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.485724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1020  DNA polymerase beta subunit  31.71 
 
 		 106 aa  40.8  0.007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>