36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_0499 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_0499  nucleotidyltransferase domain-containing protein  100 
 
 		 102 aa  209  1e-53  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2490  DNA polymerase beta domain protein region  40.2 
 
 		 110 aa  77.4  0.00000000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1028  DNA polymerase beta domain protein region  38.14 
 
 		 111 aa  65.9  0.0000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000129156  normal  0.703188 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0606  DNA polymerase beta domain protein region  33.66 
 
 		 105 aa  59.3  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000675523 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0216  hypothetical protein  32.67 
 
 		 103 aa  58.9  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0242312  hitchhiker  0.0000000000000575833 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0997  DNA polymerase beta subunit  39.18 
 
 		 115 aa  58.9  0.00000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.995341  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3922  DNA polymerase beta subunit  41.57 
 
 		 117 aa  58.5  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0657046 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0083  hypothetical protein  34 
 
 		 111 aa  57.8  0.00000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.394074  normal  0.26212 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3846  DNA polymerase beta subunit  36.26 
 
 		 121 aa  55.8  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000154582  unclonable  0.00000693944 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0236  DNA polymerase beta subunit  30.77 
 
 		 103 aa  55.1  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1450  DNA polymerase beta subunit  44.12 
 
 		 115 aa  54.7  0.0000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.374866 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2432  DNA polymerase beta subunit  29 
 
 		 111 aa  51.6  0.000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.71469  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1681  DNA polymerase, beta-like region  32.58 
 
 		 107 aa  50.8  0.000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.044025  normal  1 
 
 
-
 
NC_011774  BCG9842_A0076  nucleotidyltransferase domain protein  31.07 
 
 		 110 aa  50.4  0.000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.467951  normal  0.54284 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0365  DNA polymerase beta subunit  29 
 
 		 113 aa  49.7  0.00001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.200117 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0576  DNA polymerase beta subunit  31.87 
 
 		 121 aa  49.7  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.887062  normal  0.28507 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0737  nucleotidyltransferase  34.23 
 
 		 107 aa  48.1  0.00003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0618  DNA polymerase beta domain protein region  25.74 
 
 		 106 aa  48.1  0.00004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.686113  normal  0.81414 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0102  nucleotidyltransferase domain-containing protein  34.94 
 
 		 128 aa  47.4  0.00006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0913883  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0040  nucleotidyltransferase domain protein  34.94 
 
 		 128 aa  47.4  0.00006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000549944 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0063  nucleotidyltransferase domain protein  34.94 
 
 		 128 aa  47.4  0.00006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0037  nucleotidyltransferase domain-containing protein  31.13 
 
 		 132 aa  46.6  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2147  DNA polymerase beta domain protein region  25.51 
 
 		 112 aa  45.8  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1920  DNA polymerase beta subunit  34.94 
 
 		 116 aa  45.1  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000388354 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4127  hypothetical protein  40 
 
 		 191 aa  45.1  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000129079 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0574  DNA polymerase beta subunit  33.33 
 
 		 120 aa  44.7  0.0005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.412375  normal  0.178688 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1725  DNA polymerase beta subunit  29.35 
 
 		 111 aa  43.5  0.0009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000013917  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3233  nucleotidyltransferase domain protein  39.68 
 
 		 166 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.73519  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1577  DNA polymerase, beta-like region  27.85 
 
 		 104 aa  43.1  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000241752  normal  0.133279 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1336  DNA polymerase beta subunit  29.29 
 
 		 120 aa  43.1  0.001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2347  DNA polymerase beta subunit  28.71 
 
 		 116 aa  43.1  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.048778  normal  0.250853 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0317  DNA polymerase beta domain protein region  33.33 
 
 		 121 aa  42.7  0.002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2718  DNA polymerase, beta-like region  37.04 
 
 		 109 aa  42  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000888869  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3225  nucleotidyltransferase domain-containing protein  34.12 
 
 		 166 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00907014  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5390  DNA polymerase beta domain protein region  27.63 
 
 		 191 aa  40.8  0.006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.536785  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0929  DNA polymerase beta domain protein region  34.85 
 
 		 96 aa  40.4  0.009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.887181  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>