39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_26330 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_26330  predicted nucleotidyltransferase  100 
 
 		 121 aa  244  2e-64  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.155672  normal  0.055633 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10090  predicted nucleotidyltransferase  46 
 
 		 106 aa  74.3  0.0000000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1812  DNA polymerase beta subunit  45.21 
 
 		 96 aa  56.2  0.0000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.337517  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3299  DNA polymerase beta domain protein region  38.89 
 
 		 96 aa  50.4  0.000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000315403 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2148  DNA polymerase beta domain protein region  39.13 
 
 		 96 aa  50.4  0.000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.664175  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3457  DNA polymerase beta subunit  42.17 
 
 		 98 aa  49.7  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0288007 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1408  DNA polymerase beta subunit  37.68 
 
 		 96 aa  48.9  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0274  DNA polymerase beta subunit  37.5 
 
 		 96 aa  48.1  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.122937  unclonable  0.00000800451 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0854  DNA polymerase beta subunit  39.47 
 
 		 96 aa  47.8  0.00005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2288  DNA polymerase, beta-like region  40.91 
 
 		 96 aa  47.4  0.00006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0033  transcriptional regulator, XRE family  41.77 
 
 		 169 aa  47.4  0.00006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.400371  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1527  transcriptional regulator, XRE family  47.92 
 
 		 145 aa  47  0.00008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0929  DNA polymerase beta domain protein region  32.61 
 
 		 96 aa  46.2  0.0001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.887181  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3140  DNA polymerase beta domain protein region  38.46 
 
 		 97 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.440273 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2969  DNA polymerase beta domain protein region  38.46 
 
 		 97 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0157  DNA polymerase beta domain protein region  39.02 
 
 		 109 aa  46.6  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0258  DNA polymerase beta domain protein region  34.62 
 
 		 97 aa  44.3  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1277  DNA polymerase beta subunit  30.97 
 
 		 111 aa  43.9  0.0007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1241  DNA polymerase beta domain-containing protein region  37.5 
 
 		 101 aa  43.5  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.282265  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19940  predicted nucleotidyltransferase  47.5 
 
 		 100 aa  42.7  0.001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0104125 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5548  DNA polymerase beta subunit  40 
 
 		 93 aa  43.1  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.861724  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1104  DNA polymerase beta domain protein region  35.62 
 
 		 96 aa  42.7  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0953254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2452  DNA polymerase, beta-like region  35.29 
 
 		 96 aa  42  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000219498  normal  0.98292 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2165  DNA polymerase beta subunit  31.88 
 
 		 151 aa  42.4  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2366  DNA polymerase beta subunit  38.36 
 
 		 115 aa  42.4  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.878119  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2072  DNA polymerase beta domain protein region  39.58 
 
 		 97 aa  42  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0110003  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1203  DNA polymerase beta domain protein region  32.08 
 
 		 102 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3922  DNA polymerase beta subunit  43.1 
 
 		 117 aa  42  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0657046 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3203  DNA polymerase beta subunit  36.11 
 
 		 98 aa  41.2  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0015  hypothetical protein  38.81 
 
 		 95 aa  41.6  0.004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2462  DNA polymerase beta subunit  34.52 
 
 		 98 aa  41.2  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.266656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1113  DNA polymerase beta subunit  40.54 
 
 		 109 aa  41.2  0.005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2714  DNA polymerase, beta-like region  43.08 
 
 		 110 aa  40.8  0.006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.505964  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3743  DNA polymerase beta domain protein region  33.73 
 
 		 98 aa  40.8  0.007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2779  DNA polymerase beta subunit  34.62 
 
 		 235 aa  40.4  0.007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0703  DNA polymerase beta domain protein region  35.42 
 
 		 109 aa  40.8  0.007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000025763  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2705  DNA polymerase, beta-like region  39.29 
 
 		 102 aa  40.4  0.008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.569902  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1766  DNA polymerase beta domain protein region  43.9 
 
 		 100 aa  40.4  0.008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.669718  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0152  DNA polymerase  38.89 
 
 		 100 aa  40  0.01  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>