78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene XfasM23_1812 on replicon NC_010577
Organism: Xylella fastidiosa M23



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010577  XfasM23_1812  DNA polymerase beta subunit  100 
 
 		 96 aa  189  1e-47  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.337517  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2148  DNA polymerase beta domain protein region  88.54 
 
 		 96 aa  168  2e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.664175  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1408  DNA polymerase beta subunit  85.42 
 
 		 96 aa  164  2.9999999999999998e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2288  DNA polymerase, beta-like region  70.83 
 
 		 96 aa  137  6e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2452  DNA polymerase, beta-like region  62.5 
 
 		 96 aa  122  2e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000219498  normal  0.98292 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0168  ISSo9, nucleotidyltransferase domain-containing protein  72.92 
 
 		 96 aa  119  9.999999999999999e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.172039  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0017  ISSo9, nucleotidyltransferase domain-containing protein  72.92 
 
 		 96 aa  119  9.999999999999999e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.378069  n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0012  DNA polymerase, beta-like region  81.4 
 
 		 88 aa  111  4.0000000000000004e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0162009  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2046  hypothetical protein  58.65 
 
 		 135 aa  109  1.0000000000000001e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.408644  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5352  DNA polymerase, beta-like region  56.84 
 
 		 98 aa  102  1e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.102703 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50230  DNA polymerase, beta-like region-containing protein  55.21 
 
 		 96 aa  102  2e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1104  DNA polymerase beta domain protein region  52.08 
 
 		 96 aa  98.6  2e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0953254  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3618  DNA polymerase beta domain protein region  50 
 
 		 96 aa  88.6  3e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1652  ISSo9, nucleotidyltransferase domain-containing protein  57.97 
 
 		 69 aa  81.3  0.000000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.175672 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3299  DNA polymerase beta domain protein region  42.22 
 
 		 96 aa  69.3  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000315403 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1527  transcriptional regulator, XRE family  48.96 
 
 		 145 aa  69.3  0.00000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0274  DNA polymerase beta subunit  43.68 
 
 		 96 aa  68.6  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.122937  unclonable  0.00000800451 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3457  DNA polymerase beta subunit  44.05 
 
 		 98 aa  66.6  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0288007 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2366  DNA polymerase beta subunit  43.33 
 
 		 115 aa  63.9  0.0000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.878119  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5548  DNA polymerase beta subunit  43.68 
 
 		 93 aa  63.2  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.861724  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0033  transcriptional regulator, XRE family  41.38 
 
 		 169 aa  62.4  0.000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.400371  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1512  ISSo9, nucleotidyltransferase domain-containing protein  33.33 
 
 		 96 aa  62  0.000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0340826  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2072  DNA polymerase beta domain protein region  37.76 
 
 		 97 aa  57.8  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0110003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0854  DNA polymerase beta subunit  37.78 
 
 		 96 aa  57.8  0.00000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3260  transcriptional regulator, XRE family  42.86 
 
 		 152 aa  57  0.00000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26330  predicted nucleotidyltransferase  45.21 
 
 		 121 aa  56.2  0.0000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.155672  normal  0.055633 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1766  DNA polymerase beta domain protein region  43.33 
 
 		 100 aa  55.5  0.0000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.669718  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1790  DNA polymerase beta domain protein region  41.89 
 
 		 114 aa  54.7  0.0000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0697  DNA polymerase beta subunit  35.56 
 
 		 96 aa  54.7  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.424952 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4907  DNA polymerase beta domain protein region  37.23 
 
 		 97 aa  54.7  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1883  DNA polymerase, beta-like region  35.56 
 
 		 108 aa  54.7  0.0000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.230497 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2714  DNA polymerase, beta-like region  38.55 
 
 		 110 aa  54.3  0.0000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.505964  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1203  DNA polymerase beta domain protein region  36.27 
 
 		 102 aa  54.3  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3146  DNA polymerase beta domain protein region  42.05 
 
 		 98 aa  54.3  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.94354 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0152  DNA polymerase  36.08 
 
 		 100 aa  53.1  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1228  DNA polymerase beta subunit  37.93 
 
 		 97 aa  52.8  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0258  DNA polymerase beta domain protein region  38.95 
 
 		 97 aa  52.4  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10090  predicted nucleotidyltransferase  38.04 
 
 		 106 aa  51.6  0.000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0357  DNA polymerase beta subunit  49.28 
 
 		 101 aa  51.6  0.000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0316504 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3140  DNA polymerase beta domain protein region  36.17 
 
 		 97 aa  51.2  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.440273 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2969  DNA polymerase beta domain protein region  36.17 
 
 		 97 aa  51.2  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2453  DNA polymerase beta subunit  45.71 
 
 		 100 aa  49.7  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00090311  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1345  DNA polymerase, beta-like region  50.98 
 
 		 55 aa  48.5  0.00003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.230797 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0202  DNA polymerase beta domain protein region  33.33 
 
 		 131 aa  46.6  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.368731 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1789  DNA polymerase beta domain protein region  30.69 
 
 		 109 aa  47  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0898  DNA polymerase, beta-like region  34.78 
 
 		 103 aa  46.6  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1298  hypothetical protein  40 
 
 		 97 aa  45.8  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0943  DNA polymerase beta subunit  37.5 
 
 		 97 aa  45.4  0.0003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.744259 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1694  DNA polymerase beta subunit  31.71 
 
 		 97 aa  44.7  0.0004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.366424  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2036  DNA polymerase beta domain protein region  33.75 
 
 		 98 aa  45.1  0.0004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.18823  normal  0.524072 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3117  DNA polymerase beta subunit  31.52 
 
 		 110 aa  44.7  0.0005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1295  DNA polymerase beta domain protein region  33.73 
 
 		 99 aa  44.3  0.0006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.599396  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0296  DNA polymerase beta domain protein region  31.08 
 
 		 97 aa  44.3  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.499305 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2672  DNA polymerase, beta-like region  40 
 
 		 96 aa  43.9  0.0008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.836328  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0627  DNA polymerase beta subunit  29.63 
 
 		 101 aa  43.9  0.0008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1188  DNA polymerase beta domain protein region  31.25 
 
 		 113 aa  43.9  0.0008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0444  nucleotidyltransferase  36 
 
 		 98 aa  43.9  0.0008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.190147  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0052  DNA polymerase beta subunit  29.63 
 
 		 101 aa  43.9  0.0008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0550488  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0088  DNA polymerase beta subunit  33.33 
 
 		 103 aa  42.7  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0340868 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0274  hypothetical protein  37.93 
 
 		 112 aa  43.1  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0998  DNA polymerase beta domain protein region  34.94 
 
 		 102 aa  42  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.050559 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3786  DNA polymerase beta domain protein region  33.78 
 
 		 97 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.123289  normal  0.700807 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1968  nucleotidyltransferase  31.18 
 
 		 99 aa  42.4  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2705  DNA polymerase, beta-like region  33.8 
 
 		 102 aa  42.4  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.569902  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2147  DNA polymerase beta domain protein region  32.69 
 
 		 112 aa  41.6  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0871  DNA polymerase beta domain protein region  32.63 
 
 		 99 aa  42  0.003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19940  predicted nucleotidyltransferase  40.79 
 
 		 100 aa  41.6  0.004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0104125 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2359  DNA polymerase beta domain protein region  36.23 
 
 		 100 aa  40.8  0.006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1203  DNA polymerase, beta-like region  32.95 
 
 		 96 aa  40.8  0.006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.229672  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0547  DNA polymerase beta subunit  35.44 
 
 		 100 aa  40.8  0.006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.790238  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0053  DNA polymerase beta subunit  28.12 
 
 		 102 aa  40.8  0.007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0582464  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1948  DNA polymerase beta domain protein region  30.77 
 
 		 96 aa  40.8  0.007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.506279 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1959  DNA polymerase beta domain protein region  30.77 
 
 		 96 aa  40.8  0.007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.332639 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1113  DNA polymerase beta subunit  38.57 
 
 		 109 aa  40.4  0.007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1784  nucleotidyltransferase  29.03 
 
 		 97 aa  40.4  0.008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3948  DNA polymerase beta subunit  34.09 
 
 		 97 aa  40.4  0.009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0222602 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1806  DNA polymerase beta domain protein region  32.86 
 
 		 104 aa  40  0.01  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.943156  normal  0.843762 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0626  DNA polymerase beta subunit  28.12 
 
 		 102 aa  40  0.01  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.717752  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>