25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A2046 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007614  Nmul_A2046  hypothetical protein  100 
 
 		 135 aa  271  3e-72  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.408644  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1408  DNA polymerase beta subunit  66.02 
 
 		 96 aa  118  3e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2148  DNA polymerase beta domain protein region  65.05 
 
 		 96 aa  117  6e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.664175  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1812  DNA polymerase beta subunit  58.65 
 
 		 96 aa  109  1.0000000000000001e-23  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.337517  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2288  DNA polymerase, beta-like region  81.36 
 
 		 96 aa  99.4  2e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2452  DNA polymerase, beta-like region  62.71 
 
 		 96 aa  75.1  0.0000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000219498  normal  0.98292 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0168  ISSo9, nucleotidyltransferase domain-containing protein  76.27 
 
 		 96 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.172039  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5352  DNA polymerase, beta-like region  62.07 
 
 		 98 aa  65.9  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.102703 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0017  ISSo9, nucleotidyltransferase domain-containing protein  76.27 
 
 		 96 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.378069  n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0012  DNA polymerase, beta-like region  90.38 
 
 		 88 aa  63.9  0.0000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0162009  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50230  DNA polymerase, beta-like region-containing protein  52.54 
 
 		 96 aa  62.8  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1104  DNA polymerase beta domain protein region  48.33 
 
 		 96 aa  59.3  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0953254  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1527  transcriptional regulator, XRE family  53.7 
 
 		 145 aa  53.5  0.0000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3618  DNA polymerase beta domain protein region  47.46 
 
 		 96 aa  49.7  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1345  DNA polymerase, beta-like region  50.98 
 
 		 55 aa  47  0.00008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.230797 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3299  DNA polymerase beta domain protein region  45.1 
 
 		 96 aa  44.3  0.0006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000315403 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5548  DNA polymerase beta subunit  46 
 
 		 93 aa  43.5  0.0009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.861724  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19940  predicted nucleotidyltransferase  48.21 
 
 		 100 aa  43.5  0.001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0104125 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3260  transcriptional regulator, XRE family  42.37 
 
 		 152 aa  43.1  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0274  DNA polymerase beta subunit  43.14 
 
 		 96 aa  43.5  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.122937  unclonable  0.00000800451 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2366  DNA polymerase beta subunit  36.17 
 
 		 115 aa  42  0.003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.878119  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1512  ISSo9, nucleotidyltransferase domain-containing protein  37.5 
 
 		 96 aa  42  0.003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0340826  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1652  ISSo9, nucleotidyltransferase domain-containing protein  56.25 
 
 		 69 aa  40.8  0.006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.175672 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3457  DNA polymerase beta subunit  44 
 
 		 98 aa  40.4  0.009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0288007 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26330  predicted nucleotidyltransferase  38.46 
 
 		 121 aa  40.4  0.009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.155672  normal  0.055633 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>