98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_5352 on replicon NC_007950
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007950  Bpro_5352  DNA polymerase, beta-like region  100 
 
 		 98 aa  191  4e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.102703 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50230  DNA polymerase, beta-like region-containing protein  62.11 
 
 		 96 aa  116  9.999999999999999e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3618  DNA polymerase beta domain protein region  61.05 
 
 		 96 aa  110  9e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2452  DNA polymerase, beta-like region  57.89 
 
 		 96 aa  107  4.0000000000000004e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000219498  normal  0.98292 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1408  DNA polymerase beta subunit  62.11 
 
 		 96 aa  107  5e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2148  DNA polymerase beta domain protein region  60 
 
 		 96 aa  106  1e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.664175  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1812  DNA polymerase beta subunit  56.84 
 
 		 96 aa  102  1e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.337517  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1104  DNA polymerase beta domain protein region  54.35 
 
 		 96 aa  102  2e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0953254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2288  DNA polymerase, beta-like region  55.79 
 
 		 96 aa  97.8  4e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0168  ISSo9, nucleotidyltransferase domain-containing protein  65.26 
 
 		 96 aa  93.6  7e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.172039  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0017  ISSo9, nucleotidyltransferase domain-containing protein  65.26 
 
 		 96 aa  93.6  7e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.378069  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3457  DNA polymerase beta subunit  46.24 
 
 		 98 aa  83.2  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0288007 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1652  ISSo9, nucleotidyltransferase domain-containing protein  56.52 
 
 		 69 aa  80.5  0.000000000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.175672 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3299  DNA polymerase beta domain protein region  46.74 
 
 		 96 aa  79.3  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000315403 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1228  DNA polymerase beta subunit  45.16 
 
 		 97 aa  75.5  0.0000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0274  DNA polymerase beta subunit  41.3 
 
 		 96 aa  73.2  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.122937  unclonable  0.00000800451 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0854  DNA polymerase beta subunit  45.65 
 
 		 96 aa  73.2  0.000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2366  DNA polymerase beta subunit  47.73 
 
 		 115 aa  72  0.000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.878119  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5548  DNA polymerase beta subunit  44.44 
 
 		 93 aa  71.6  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.861724  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2705  DNA polymerase, beta-like region  39.58 
 
 		 102 aa  68.9  0.00000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.569902  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2072  DNA polymerase beta domain protein region  41.49 
 
 		 97 aa  66.6  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0110003  normal  1 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0012  DNA polymerase, beta-like region  64.79 
 
 		 88 aa  65.5  0.0000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0162009  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2046  hypothetical protein  62.07 
 
 		 135 aa  65.9  0.0000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.408644  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0033  transcriptional regulator, XRE family  42.22 
 
 		 169 aa  64.7  0.0000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.400371  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1694  DNA polymerase beta subunit  36.56 
 
 		 97 aa  63.9  0.0000000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.366424  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3146  DNA polymerase beta domain protein region  41.94 
 
 		 98 aa  63.5  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.94354 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3140  DNA polymerase beta domain protein region  38.3 
 
 		 97 aa  63.2  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.440273 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2969  DNA polymerase beta domain protein region  38.3 
 
 		 97 aa  63.2  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0357  DNA polymerase beta subunit  50.67 
 
 		 101 aa  62.8  0.000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0316504 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1295  DNA polymerase beta domain protein region  34.02 
 
 		 99 aa  61.6  0.000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.599396  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1203  DNA polymerase beta domain protein region  41.94 
 
 		 102 aa  61.2  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1766  DNA polymerase beta domain protein region  44.44 
 
 		 100 aa  60.8  0.000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.669718  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0258  DNA polymerase beta domain protein region  38.95 
 
 		 97 aa  60.5  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1790  DNA polymerase beta domain protein region  38.89 
 
 		 114 aa  59.7  0.00000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4907  DNA polymerase beta domain protein region  38.04 
 
 		 97 aa  59.3  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3260  transcriptional regulator, XRE family  37.89 
 
 		 152 aa  58.5  0.00000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2714  DNA polymerase, beta-like region  34.88 
 
 		 110 aa  57.8  0.00000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.505964  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1298  hypothetical protein  42.22 
 
 		 97 aa  57.4  0.00000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1527  transcriptional regulator, XRE family  41.05 
 
 		 145 aa  57  0.00000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1512  ISSo9, nucleotidyltransferase domain-containing protein  33.68 
 
 		 96 aa  56.2  0.0000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0340826  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1851  DNA polymerase beta domain protein region  36.17 
 
 		 96 aa  55.5  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1877  DNA polymerase beta domain protein region  36.17 
 
 		 96 aa  55.5  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1789  DNA polymerase beta domain protein region  37.84 
 
 		 109 aa  54.7  0.0000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1345  DNA polymerase, beta-like region  60 
 
 		 55 aa  54.7  0.0000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.230797 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10090  predicted nucleotidyltransferase  42.11 
 
 		 106 aa  52.4  0.000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3557  DNA polymerase beta subunit  36.26 
 
 		 254 aa  52.8  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0946906  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0871  DNA polymerase beta domain protein region  39.77 
 
 		 99 aa  52  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2359  DNA polymerase beta domain protein region  40.3 
 
 		 100 aa  52  0.000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2453  DNA polymerase beta subunit  40 
 
 		 100 aa  50.4  0.000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00090311  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1733  DNA polymerase beta domain protein region  33.66 
 
 		 98 aa  50.4  0.000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.3433 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0998  DNA polymerase beta domain protein region  35.71 
 
 		 102 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.050559 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0627  DNA polymerase beta subunit  31.52 
 
 		 101 aa  48.9  0.00002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0052  DNA polymerase beta subunit  31.52 
 
 		 101 aa  48.9  0.00002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0550488  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0444  nucleotidyltransferase  36.84 
 
 		 98 aa  49.3  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.190147  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0638  nucleotidyltransferase  39.73 
 
 		 101 aa  48.9  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0898  DNA polymerase, beta-like region  41.18 
 
 		 103 aa  48.9  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1102  hypothetical protein  29.55 
 
 		 100 aa  48.1  0.00004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.836571  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3147  DNA polymerase beta domain protein region  40 
 
 		 96 aa  47.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.949814 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1959  DNA polymerase beta domain protein region  32.58 
 
 		 96 aa  47.8  0.00005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.332639 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1883  DNA polymerase, beta-like region  38.64 
 
 		 108 aa  47.8  0.00005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.230497 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1948  DNA polymerase beta domain protein region  32.58 
 
 		 96 aa  47.8  0.00005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.506279 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0697  DNA polymerase beta subunit  38.64 
 
 		 96 aa  47.8  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.424952 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5818  DNA polymerase beta domain protein region  35.87 
 
 		 96 aa  47  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3117  DNA polymerase beta subunit  40.3 
 
 		 110 aa  47  0.00008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0943  DNA polymerase beta subunit  36.11 
 
 		 97 aa  46.6  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.744259 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3786  DNA polymerase beta domain protein region  33.78 
 
 		 97 aa  46.2  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.123289  normal  0.700807 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1203  DNA polymerase, beta-like region  34.78 
 
 		 96 aa  45.8  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.229672  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1188  DNA polymerase beta domain protein region  36 
 
 		 113 aa  45.1  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0626  DNA polymerase beta subunit  37.31 
 
 		 102 aa  45.1  0.0003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.717752  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0053  DNA polymerase beta subunit  37.31 
 
 		 102 aa  45.1  0.0003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0582464  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2672  DNA polymerase, beta-like region  35.96 
 
 		 96 aa  45.4  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.836328  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0374  DNA polymerase beta subunit  36 
 
 		 108 aa  45.1  0.0004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.509035  normal  0.373075 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0547  DNA polymerase beta subunit  35.79 
 
 		 100 aa  44.7  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.790238  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0296  DNA polymerase beta domain protein region  30.26 
 
 		 97 aa  44.3  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.499305 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1221  nucleotidyltransferase domain-containing protein  50.98 
 
 		 64 aa  44.3  0.0006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.795397  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1342  DNA polymerase beta domain protein region  43.06 
 
 		 111 aa  43.9  0.0007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3948  DNA polymerase beta subunit  35.87 
 
 		 97 aa  43.9  0.0008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0222602 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1784  nucleotidyltransferase  41.56 
 
 		 97 aa  43.5  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0202  DNA polymerase beta domain protein region  36.78 
 
 		 131 aa  42.7  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.368731 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1806  DNA polymerase beta domain protein region  38.27 
 
 		 104 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.943156  normal  0.843762 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0686  DNA polymerase beta subunit  38.36 
 
 		 96 aa  42.7  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0845  DNA polymerase beta subunit  39.47 
 
 		 96 aa  41.6  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.406591  normal  0.358781 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2036  DNA polymerase beta domain protein region  32.95 
 
 		 98 aa  42  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.18823  normal  0.524072 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1075  DNA polymerase beta domain protein region  34.72 
 
 		 97 aa  42  0.003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.796392  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0929  DNA polymerase beta domain protein region  40 
 
 		 96 aa  42  0.003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.887181  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0867  DNA polymerase beta domain protein region  31.94 
 
 		 96 aa  41.6  0.004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19940  predicted nucleotidyltransferase  44.64 
 
 		 100 aa  41.6  0.004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0104125 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0548  DNA polymerase beta domain protein region  36.49 
 
 		 102 aa  41.6  0.004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1164  DNA polymerase beta subunit  29.21 
 
 		 113 aa  41.2  0.004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1475  DNA polymerase beta domain protein region  34.48 
 
 		 129 aa  40.8  0.006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.125283  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0152  DNA polymerase  32.95 
 
 		 100 aa  40.8  0.007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0506  DNA polymerase beta subunit  30.56 
 
 		 96 aa  40.8  0.007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0949  DNA polymerase beta subunit  31.58 
 
 		 102 aa  40.8  0.007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.878884  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0479  DNA polymerase, beta-like region  34.88 
 
 		 105 aa  40.4  0.009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4395  hypothetical protein  37.25 
 
 		 121 aa  40  0.009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0622266 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3484  DNA polymerase beta domain protein region  36.11 
 
 		 115 aa  40  0.01  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.628631 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1803  DNA polymerase beta domain protein region  34.67 
 
 		 96 aa  40  0.01  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2704  DNA polymerase beta domain-containing protein region  36.84 
 
 		 95 aa  40  0.01  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.272306 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>