39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1221 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_1221  nucleotidyltransferase domain-containing protein  100 
 
 		 64 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.795397  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1228  DNA polymerase beta subunit  66.15 
 
 		 97 aa  78.6  0.00000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3299  DNA polymerase beta domain protein region  62.3 
 
 		 96 aa  68.6  0.00000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000315403 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3457  DNA polymerase beta subunit  52.38 
 
 		 98 aa  63.9  0.0000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0288007 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1766  DNA polymerase beta domain protein region  60.71 
 
 		 100 aa  62  0.000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.669718  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0274  DNA polymerase beta subunit  52.46 
 
 		 96 aa  60.8  0.000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.122937  unclonable  0.00000800451 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1790  DNA polymerase beta domain protein region  50 
 
 		 114 aa  60.1  0.00000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1298  hypothetical protein  51.72 
 
 		 97 aa  59.7  0.00000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2366  DNA polymerase beta subunit  53.45 
 
 		 115 aa  58.9  0.00000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.878119  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0258  DNA polymerase beta domain protein region  51.85 
 
 		 97 aa  57.8  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3146  DNA polymerase beta domain protein region  52.83 
 
 		 98 aa  56.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.94354 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0854  DNA polymerase beta subunit  40.62 
 
 		 96 aa  55.1  0.0000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2705  DNA polymerase, beta-like region  44.44 
 
 		 102 aa  54.7  0.0000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.569902  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4907  DNA polymerase beta domain protein region  50 
 
 		 97 aa  53.9  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3948  DNA polymerase beta subunit  48.21 
 
 		 97 aa  52  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0222602 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2072  DNA polymerase beta domain protein region  51.02 
 
 		 97 aa  52  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0110003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4395  hypothetical protein  48.98 
 
 		 121 aa  51.6  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0622266 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2969  DNA polymerase beta domain protein region  42.59 
 
 		 97 aa  51.2  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3140  DNA polymerase beta domain protein region  42.59 
 
 		 97 aa  51.2  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.440273 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1203  DNA polymerase, beta-like region  46.3 
 
 		 96 aa  51.2  0.000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.229672  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5548  DNA polymerase beta subunit  42.59 
 
 		 93 aa  47  0.00009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.861724  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2672  DNA polymerase, beta-like region  42.86 
 
 		 96 aa  46.2  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.836328  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0862  DNA polymerase beta domain protein region  46.15 
 
 		 101 aa  46.2  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000634599  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1789  DNA polymerase beta domain protein region  39.29 
 
 		 109 aa  44.7  0.0004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0444  nucleotidyltransferase  41.51 
 
 		 98 aa  44.7  0.0005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.190147  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5352  DNA polymerase, beta-like region  50.98 
 
 		 98 aa  44.3  0.0006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.102703 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2453  DNA polymerase beta subunit  43.64 
 
 		 100 aa  43.9  0.0007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00090311  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0898  DNA polymerase, beta-like region  40 
 
 		 103 aa  43.9  0.0008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50230  DNA polymerase, beta-like region-containing protein  47.06 
 
 		 96 aa  42.4  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19940  predicted nucleotidyltransferase  45.28 
 
 		 100 aa  42.7  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0104125 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0374  DNA polymerase beta subunit  39.13 
 
 		 108 aa  42  0.003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.509035  normal  0.373075 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1203  DNA polymerase beta domain protein region  48.84 
 
 		 102 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0033  transcriptional regulator, XRE family  44 
 
 		 169 aa  42  0.003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.400371  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1162  DNA polymerase beta subunit  42.86 
 
 		 100 aa  41.2  0.004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0845  DNA polymerase beta subunit  58.06 
 
 		 96 aa  41.2  0.005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.406591  normal  0.358781 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0587  DNA polymerase, beta-like region  40 
 
 		 76 aa  41.2  0.005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.204552  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0927  hypothetical protein  36.21 
 
 		 109 aa  40.8  0.006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.430224  normal  0.445553 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0142  nucleotidyltransferase  38.89 
 
 		 86 aa  40.8  0.007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2493  DNA polymerase beta domain-containing protein region  44.74 
 
 		 96 aa  40.8  0.007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>