140 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_0927 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008942  Mlab_0927  hypothetical protein  100 
 
 		 109 aa  221  3e-57  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.430224  normal  0.445553 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0886  hypothetical protein  45.79 
 
 		 129 aa  98.2  4e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0454668  hitchhiker  0.00000000702025 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1637  DNA polymerase beta subunit  40 
 
 		 106 aa  85.1  3e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0348  DNA polymerase beta subunit  39.13 
 
 		 94 aa  72  0.000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0374  DNA polymerase beta subunit  35.42 
 
 		 108 aa  72.4  0.000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.509035  normal  0.373075 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0547  DNA polymerase beta subunit  42.55 
 
 		 100 aa  70.9  0.000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.790238  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0506  DNA polymerase beta subunit  39.77 
 
 		 96 aa  67.8  0.00000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1784  nucleotidyltransferase  39.77 
 
 		 97 aa  67.4  0.00000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0862  DNA polymerase beta domain protein region  36.84 
 
 		 101 aa  67  0.00000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000634599  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1203  DNA polymerase, beta-like region  37.35 
 
 		 96 aa  66.6  0.0000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.229672  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0638  nucleotidyltransferase  39 
 
 		 101 aa  66.2  0.0000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0867  DNA polymerase beta domain protein region  38.64 
 
 		 96 aa  66.6  0.0000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0142  nucleotidyltransferase  42.67 
 
 		 86 aa  65.1  0.0000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2422  DNA polymerase, beta-like region  32.98 
 
 		 109 aa  64.7  0.0000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1691  DNA polymerase beta domain protein region  35.87 
 
 		 101 aa  64.3  0.0000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0273  DNA polymerase, beta-like region  37.63 
 
 		 98 aa  62.4  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.288603 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0241  DNA polymerase beta subunit  35.71 
 
 		 99 aa  62.4  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0627  DNA polymerase beta subunit  40.23 
 
 		 101 aa  62  0.000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0900  DNA polymerase beta subunit  36.84 
 
 		 103 aa  62  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000013918 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0052  DNA polymerase beta subunit  40.23 
 
 		 101 aa  62  0.000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0550488  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2672  DNA polymerase, beta-like region  35.29 
 
 		 96 aa  61.2  0.000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.836328  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2493  DNA polymerase beta domain-containing protein region  39.36 
 
 		 96 aa  61.2  0.000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3265  DNA polymerase beta subunit  39.77 
 
 		 87 aa  61.2  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00407875  normal  0.255152 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5818  DNA polymerase beta domain protein region  44.87 
 
 		 96 aa  60.8  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3031  DNA polymerase beta subunit  39.78 
 
 		 96 aa  60.5  0.000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.424813  normal  0.471509 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1883  DNA polymerase, beta-like region  45.71 
 
 		 108 aa  58.9  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.230497 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0409  DNA polymerase beta subunit  35.87 
 
 		 96 aa  59.3  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2036  DNA polymerase beta domain protein region  40.45 
 
 		 98 aa  58.9  0.00000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.18823  normal  0.524072 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1803  DNA polymerase beta domain protein region  40.86 
 
 		 96 aa  58.9  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0548  nucleotidyltransferase family protein  34.48 
 
 		 93 aa  58.2  0.00000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0686  DNA polymerase beta subunit  39.78 
 
 		 96 aa  58.5  0.00000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3948  DNA polymerase beta subunit  34.41 
 
 		 97 aa  58.2  0.00000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0222602 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2532  DNA polymerase beta subunit  35.87 
 
 		 104 aa  58.2  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0127103 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0697  DNA polymerase beta subunit  45.71 
 
 		 96 aa  58.2  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.424952 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0152  DNA polymerase  43.04 
 
 		 100 aa  57.8  0.00000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1036  DNA polymerase beta domain protein region  30.53 
 
 		 96 aa  57.4  0.00000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0795086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0088  DNA polymerase beta subunit  35.79 
 
 		 103 aa  57  0.00000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0340868 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0202  DNA polymerase beta domain protein region  38.89 
 
 		 131 aa  57  0.00000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.368731 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2462  DNA polymerase beta subunit  37.78 
 
 		 98 aa  57  0.00000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.266656  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2757  nucleotidyltransferase family protein  33.7 
 
 		 102 aa  55.8  0.0000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0028  nucleotidyltransferase family protein  34.41 
 
 		 96 aa  55.8  0.0000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.422617  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1188  DNA polymerase beta domain protein region  34.88 
 
 		 113 aa  56.2  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0374  DNA polymerase, beta-like region  33.77 
 
 		 121 aa  55.5  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4165  DNA polymerase beta subunit  34.38 
 
 		 109 aa  55.8  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0279  DNA polymerase beta domain protein region  37.5 
 
 		 115 aa  56.2  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.155068  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0703  DNA polymerase beta domain protein region  32.63 
 
 		 109 aa  55.5  0.0000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000025763  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1762  nucleotidyltransferase family protein  37.63 
 
 		 97 aa  55.1  0.0000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.324196 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3299  DNA polymerase beta domain protein region  38.67 
 
 		 96 aa  54.7  0.0000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000315403 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2072  DNA polymerase beta domain protein region  36.67 
 
 		 97 aa  54.3  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0110003  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1148  DNA polymerase beta subunit  36.26 
 
 		 115 aa  53.9  0.0000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3039  DNA polymerase beta domain protein region  32.65 
 
 		 99 aa  54.3  0.0000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1162  DNA polymerase beta subunit  38.36 
 
 		 100 aa  53.9  0.0000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0274  DNA polymerase beta subunit  38.67 
 
 		 96 aa  53.9  0.0000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.122937  unclonable  0.00000800451 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2529  DNA polymerase beta subunit  34.78 
 
 		 104 aa  53.5  0.0000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0400211 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1877  DNA polymerase beta domain protein region  37.63 
 
 		 96 aa  53.5  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1851  DNA polymerase beta domain protein region  37.63 
 
 		 96 aa  53.5  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0332  DNA polymerase beta domain protein region  34.78 
 
 		 94 aa  53.1  0.000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0845  DNA polymerase beta subunit  32.98 
 
 		 96 aa  53.1  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.406591  normal  0.358781 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1075  DNA polymerase beta domain protein region  38.78 
 
 		 97 aa  53.1  0.000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.796392  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1342  DNA polymerase beta domain protein region  40 
 
 		 111 aa  53.1  0.000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3786  DNA polymerase beta domain protein region  40.91 
 
 		 97 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.123289  normal  0.700807 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1518  DNA polymerase beta domain protein region  35.79 
 
 		 104 aa  53.1  0.000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.361827  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2714  DNA polymerase, beta-like region  33.68 
 
 		 110 aa  52.8  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.505964  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3260  transcriptional regulator, XRE family  42.65 
 
 		 152 aa  52.4  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1694  DNA polymerase beta subunit  29.35 
 
 		 97 aa  52.8  0.000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.366424  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2495  DNA polymerase beta domain protein region  35.9 
 
 		 113 aa  51.6  0.000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1789  DNA polymerase beta domain protein region  37.8 
 
 		 109 aa  51.6  0.000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3676  DNA polymerase beta domain protein region  39.36 
 
 		 132 aa  50.8  0.000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.839378  normal  0.137366 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1241  DNA polymerase beta domain-containing protein region  32.04 
 
 		 101 aa  50.4  0.000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.282265  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1948  DNA polymerase beta domain protein region  34.12 
 
 		 96 aa  50.4  0.000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.506279 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1959  DNA polymerase beta domain protein region  34.12 
 
 		 96 aa  50.4  0.000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.332639 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1790  DNA polymerase beta domain protein region  37.33 
 
 		 114 aa  50.4  0.000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3117  DNA polymerase beta subunit  40.54 
 
 		 110 aa  49.7  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0844  DNA polymerase beta subunit  42.5 
 
 		 116 aa  49.7  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.909458  normal  0.0926269 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3960  DNA polymerase beta subunit  49.12 
 
 		 104 aa  50.1  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.886641  normal  0.332553 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0157  DNA polymerase beta domain protein region  30.21 
 
 		 109 aa  49.7  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2704  DNA polymerase beta domain-containing protein region  34.83 
 
 		 95 aa  50.1  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.272306 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6474  DNA polymerase beta domain protein region  46.75 
 
 		 102 aa  49.3  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1766  DNA polymerase beta domain protein region  39.24 
 
 		 100 aa  49.3  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.669718  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2017  DNA polymerase beta domain protein region  32.63 
 
 		 103 aa  49.3  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.538218  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1475  DNA polymerase beta domain protein region  38.82 
 
 		 129 aa  49.3  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.125283  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2974  DNA polymerase beta domain protein region  43.1 
 
 		 108 aa  48.9  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3135  DNA polymerase beta domain protein region  43.1 
 
 		 108 aa  48.9  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.434644 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3457  DNA polymerase beta subunit  37.5 
 
 		 98 aa  48.5  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0288007 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0949  DNA polymerase beta subunit  33.33 
 
 		 102 aa  48.5  0.00003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.878884  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0053  DNA polymerase beta subunit  38.36 
 
 		 102 aa  48.5  0.00003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0582464  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0626  DNA polymerase beta subunit  38.36 
 
 		 102 aa  48.1  0.00004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.717752  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1228  DNA polymerase beta subunit  38.67 
 
 		 97 aa  47.8  0.00005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4907  DNA polymerase beta domain protein region  37.97 
 
 		 97 aa  47.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1527  transcriptional regulator, XRE family  45.61 
 
 		 145 aa  47.4  0.00006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0347  DNA polymerase beta domain protein region  32.94 
 
 		 102 aa  47  0.00009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0033  hypothetical protein  40.68 
 
 		 110 aa  46.2  0.0001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2366  DNA polymerase beta subunit  37.65 
 
 		 115 aa  46.2  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.878119  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0943  DNA polymerase beta subunit  39.74 
 
 		 97 aa  46.6  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.744259 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5548  DNA polymerase beta subunit  30.43 
 
 		 93 aa  46.6  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.861724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0829  DNA polymerase beta subunit  28.89 
 
 		 98 aa  45.8  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.141069  normal  0.412533 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1178  DNA polymerase beta subunit  29.87 
 
 		 98 aa  45.4  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.448012  normal  0.179286 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1295  DNA polymerase beta domain protein region  32.32 
 
 		 99 aa  46.2  0.0002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.599396  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0548  DNA polymerase beta domain protein region  30.43 
 
 		 102 aa  45.1  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3557  DNA polymerase beta subunit  34.65 
 
 		 254 aa  45.1  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0946906  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>