87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_3265 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_3265  DNA polymerase beta subunit  100 
 
 		 87 aa  176  1e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00407875  normal  0.255152 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0088  DNA polymerase beta subunit  68.97 
 
 		 103 aa  129  1.0000000000000001e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0340868 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0900  DNA polymerase beta subunit  58.62 
 
 		 103 aa  103  1e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000013918 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1162  DNA polymerase beta subunit  45.78 
 
 		 100 aa  87  8e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0348  DNA polymerase beta subunit  57.53 
 
 		 94 aa  84  7e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1036  DNA polymerase beta domain protein region  43.9 
 
 		 96 aa  79.7  0.00000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0795086  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2757  nucleotidyltransferase family protein  37.93 
 
 		 102 aa  76.6  0.0000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0547  DNA polymerase beta subunit  47.56 
 
 		 100 aa  74.3  0.0000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.790238  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0862  DNA polymerase beta domain protein region  45.24 
 
 		 101 aa  73.6  0.0000000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000634599  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0374  DNA polymerase beta subunit  59.38 
 
 		 108 aa  73.6  0.0000000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.509035  normal  0.373075 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0638  nucleotidyltransferase  39.33 
 
 		 101 aa  70.9  0.000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0241  DNA polymerase beta subunit  41.86 
 
 		 99 aa  70.9  0.000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3039  DNA polymerase beta domain protein region  43.02 
 
 		 99 aa  71.2  0.000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0506  DNA polymerase beta subunit  42.86 
 
 		 96 aa  68.9  0.00000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5818  DNA polymerase beta domain protein region  45.78 
 
 		 96 aa  68.6  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0867  DNA polymerase beta domain protein region  41.56 
 
 		 96 aa  68.6  0.00000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1637  DNA polymerase beta subunit  46.84 
 
 		 106 aa  66.2  0.0000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0052  DNA polymerase beta subunit  43.28 
 
 		 101 aa  64.7  0.0000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0550488  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0627  DNA polymerase beta subunit  43.28 
 
 		 101 aa  64.7  0.0000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0142  nucleotidyltransferase  46.05 
 
 		 86 aa  63.5  0.0000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2422  DNA polymerase, beta-like region  37.65 
 
 		 109 aa  62.8  0.000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1762  nucleotidyltransferase family protein  45.68 
 
 		 97 aa  61.6  0.000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.324196 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0927  hypothetical protein  39.77 
 
 		 109 aa  61.2  0.000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.430224  normal  0.445553 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0886  hypothetical protein  40.96 
 
 		 129 aa  61.2  0.000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0454668  hitchhiker  0.00000000702025 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1691  DNA polymerase beta domain protein region  43.28 
 
 		 101 aa  60.8  0.000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3031  DNA polymerase beta subunit  39.76 
 
 		 96 aa  58.2  0.00000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.424813  normal  0.471509 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0409  DNA polymerase beta subunit  39.76 
 
 		 96 aa  57.8  0.00000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0028  nucleotidyltransferase family protein  43.28 
 
 		 96 aa  57  0.00000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.422617  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0845  DNA polymerase beta subunit  40.74 
 
 		 96 aa  55.8  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.406591  normal  0.358781 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0703  DNA polymerase beta domain protein region  39.02 
 
 		 109 aa  56.2  0.0000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000025763  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0686  DNA polymerase beta subunit  43.21 
 
 		 96 aa  55.8  0.0000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1518  DNA polymerase beta domain protein region  42.11 
 
 		 104 aa  55.5  0.0000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.361827  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2714  DNA polymerase, beta-like region  35.63 
 
 		 110 aa  54.7  0.0000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.505964  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0273  DNA polymerase, beta-like region  38.27 
 
 		 98 aa  53.9  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.288603 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2704  DNA polymerase beta domain-containing protein region  41.56 
 
 		 95 aa  53.1  0.000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.272306 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1784  nucleotidyltransferase  39.02 
 
 		 97 aa  52.4  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2017  DNA polymerase beta domain protein region  44.58 
 
 		 103 aa  52.8  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.538218  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1803  DNA polymerase beta domain protein region  33.73 
 
 		 96 aa  51.6  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0157  DNA polymerase beta domain protein region  39.24 
 
 		 109 aa  50.4  0.000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0279  DNA polymerase beta domain protein region  30.12 
 
 		 115 aa  49.7  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.155068  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3743  DNA polymerase beta domain protein region  38.55 
 
 		 98 aa  49.7  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1851  DNA polymerase beta domain protein region  37.5 
 
 		 96 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0315  DNA polymerase beta domain protein region  31.25 
 
 		 97 aa  49.3  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0889475 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0208  hypothetical protein  47.92 
 
 		 120 aa  49.3  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0639288  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1877  DNA polymerase beta domain protein region  37.5 
 
 		 96 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1694  DNA polymerase beta subunit  36.71 
 
 		 97 aa  48.5  0.00003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.366424  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3147  DNA polymerase beta domain protein region  40.24 
 
 		 96 aa  48.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.949814 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1292  DNA polymerase beta domain protein region  32.18 
 
 		 177 aa  48.1  0.00004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.114397  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0548  nucleotidyltransferase family protein  38.16 
 
 		 93 aa  47.4  0.00006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1789  DNA polymerase beta domain protein region  36.71 
 
 		 109 aa  47  0.00009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0152  DNA polymerase  37.31 
 
 		 100 aa  47  0.00009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1178  DNA polymerase beta subunit  31.58 
 
 		 98 aa  46.6  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.448012  normal  0.179286 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2192  DNA polymerase, beta-like region  34.57 
 
 		 110 aa  46.2  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.479342  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0949  DNA polymerase beta subunit  34.12 
 
 		 102 aa  47  0.0001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.878884  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2529  DNA polymerase beta subunit  36.25 
 
 		 104 aa  46.2  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0400211 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0871  DNA polymerase beta domain protein region  40.3 
 
 		 99 aa  46.2  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3117  DNA polymerase beta subunit  36.76 
 
 		 110 aa  45.8  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2495  DNA polymerase beta domain protein region  43.08 
 
 		 113 aa  45.4  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0929  DNA polymerase beta domain protein region  32.95 
 
 		 96 aa  46.2  0.0002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.887181  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0274  hypothetical protein  36.36 
 
 		 112 aa  45.1  0.0003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3960  DNA polymerase beta subunit  46.67 
 
 		 104 aa  45.4  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.886641  normal  0.332553 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1320  DNA polymerase, beta-like region  34.18 
 
 		 106 aa  45.4  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2493  DNA polymerase beta domain-containing protein region  37.66 
 
 		 96 aa  45.1  0.0003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0943  DNA polymerase beta subunit  35.9 
 
 		 97 aa  45.1  0.0004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.744259 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2532  DNA polymerase beta subunit  35 
 
 		 104 aa  44.3  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0127103 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0274  DNA polymerase beta subunit  38.16 
 
 		 96 aa  44.7  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.122937  unclonable  0.00000800451 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1241  DNA polymerase beta domain-containing protein region  36.36 
 
 		 101 aa  43.9  0.0006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.282265  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3786  DNA polymerase beta domain protein region  33.72 
 
 		 97 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.123289  normal  0.700807 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3676  DNA polymerase beta domain protein region  34.12 
 
 		 132 aa  43.1  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.839378  normal  0.137366 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2462  DNA polymerase beta subunit  34.12 
 
 		 98 aa  42.4  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.266656  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3213  DNA polymerase beta domain protein region  35.37 
 
 		 96 aa  42.7  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5548  DNA polymerase beta subunit  34.12 
 
 		 93 aa  42  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.861724  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1733  DNA polymerase beta domain protein region  32.47 
 
 		 98 aa  42  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.3433 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1188  DNA polymerase beta domain protein region  41.79 
 
 		 113 aa  41.6  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0332  DNA polymerase beta domain protein region  35.9 
 
 		 94 aa  40.8  0.006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0844  DNA polymerase beta subunit  41.43 
 
 		 116 aa  40.8  0.006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.909458  normal  0.0926269 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3135  DNA polymerase beta domain protein region  37.7 
 
 		 108 aa  40.8  0.007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.434644 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1948  DNA polymerase beta domain protein region  34.85 
 
 		 96 aa  40.4  0.007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.506279 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1959  DNA polymerase beta domain protein region  34.85 
 
 		 96 aa  40.4  0.007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.332639 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2974  DNA polymerase beta domain protein region  37.7 
 
 		 108 aa  40.8  0.007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0626  DNA polymerase beta subunit  35.14 
 
 		 102 aa  40.4  0.009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.717752  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0548  DNA polymerase beta domain protein region  36.92 
 
 		 102 aa  40  0.01  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3299  DNA polymerase beta domain protein region  32.93 
 
 		 96 aa  40  0.01  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000315403 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0369  DNA polymerase beta subunit  31.4 
 
 		 105 aa  40  0.01  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.832865  normal  0.194305 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6474  DNA polymerase beta domain protein region  32.91 
 
 		 102 aa  40  0.01  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1883  DNA polymerase, beta-like region  40.32 
 
 		 108 aa  40  0.01  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.230497 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2453  DNA polymerase beta subunit  43.48 
 
 		 100 aa  40  0.01  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00090311  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>