30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA0270 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA0270  nucleotidyltransferase domain-containing protein  100 
 
 		 135 aa  276  8e-74  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.440685  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1674  DNA polymerase, beta-like region  36.17 
 
 		 105 aa  62.8  0.000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.538651  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5240  DNA polymerase beta domain protein region  33.33 
 
 		 104 aa  62.8  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0594  hypothetical protein  27.72 
 
 		 102 aa  57  0.00000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02490  nucleotidyltransferase  29 
 
 		 103 aa  55.8  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.456196  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1349  DNA polymerase beta domain protein region  32.95 
 
 		 96 aa  54.7  0.0000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0806  nucleotidyltransferase substrate binding protein, HI0074 family  31.25 
 
 		 247 aa  54.3  0.0000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1475  DNA polymerase beta domain protein region  30.69 
 
 		 100 aa  52.8  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1691  DNA polymerase beta domain protein region  37.08 
 
 		 95 aa  51.2  0.000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0339005 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0491  hypothetical protein  34.65 
 
 		 112 aa  50.1  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.484621  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1656  DNA polymerase beta domain protein region  30.69 
 
 		 103 aa  50.1  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0233  DNA polymerase beta domain protein region  26.92 
 
 		 108 aa  49.3  0.00002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0769  DNA polymerase beta domain protein region  32.5 
 
 		 106 aa  49.3  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0095  DNA polymerase beta subunit  30 
 
 		 112 aa  49.3  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.365343 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1133  DNA polymerase beta subunit  28.95 
 
 		 123 aa  47.4  0.00006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0754  DNA polymerase beta domain protein region  32.47 
 
 		 106 aa  47.4  0.00007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.923157  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0221  hypothetical protein  38.46 
 
 		 112 aa  46.6  0.0001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1735  DNA polymerase beta domain protein region  35.64 
 
 		 106 aa  46.2  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1207  DNA polymerase beta subunit  29.27 
 
 		 105 aa  46.2  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.901472  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2848  hypothetical protein  30.91 
 
 		 108 aa  45.1  0.0003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0292  DNA polymerase beta subunit  26.21 
 
 		 108 aa  44.3  0.0005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1936  putative nucleotidyltransferase  32.26 
 
 		 107 aa  43.9  0.0008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0069  DNA polymerase beta domain protein region  29.7 
 
 		 108 aa  43.5  0.0009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4035  DNA polymerase beta subunit  43.33 
 
 		 103 aa  42.7  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1021  nucleotidyltransferase  33.67 
 
 		 99 aa  42  0.003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.598559  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1038  DNA polymerase beta subunit  28.7 
 
 		 118 aa  42  0.003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0191145  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3592  DNA polymerase beta domain protein region  43.59 
 
 		 96 aa  41.2  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000372185  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2655  DNA polymerase beta subunit  24.3 
 
 		 108 aa  41.2  0.006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.748854  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0502  DNA polymerase beta domain protein region  30 
 
 		 124 aa  40.8  0.007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1560  DNA polymerase beta domain protein region  32.47 
 
 		 105 aa  40  0.01  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>