32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_4035 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_4035  DNA polymerase beta subunit  100 
 
 		 103 aa  199  9.999999999999999e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3592  DNA polymerase beta domain protein region  47.37 
 
 		 96 aa  80.5  0.000000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000372185  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3353  DNA polymerase beta subunit  43.81 
 
 		 112 aa  80.1  0.00000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0221  hypothetical protein  37.89 
 
 		 112 aa  78.6  0.00000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0268  DNA polymerase beta domain protein region  27.37 
 
 		 100 aa  69.7  0.00000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3505  DNA polymerase beta subunit  39.58 
 
 		 115 aa  68.9  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1021  nucleotidyltransferase  35.29 
 
 		 99 aa  62.4  0.000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.598559  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3010  restriction modification system DNA specificity subunit  38.82 
 
 		 549 aa  62  0.000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.340841  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0918  putative nucleotidyltransferase  34.12 
 
 		 99 aa  60.8  0.000000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1735  DNA polymerase beta domain protein region  32.95 
 
 		 106 aa  60.5  0.000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0551  DNA polymerase beta domain protein region  37.93 
 
 		 106 aa  59.3  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2086  DNA polymerase beta subunit  36.63 
 
 		 111 aa  58.9  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.166795  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2935  DNA polymerase beta subunit  40.82 
 
 		 115 aa  58.9  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07030  nucleotidyltransferase  38.38 
 
 		 114 aa  58.5  0.00000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0417  DNA polymerase beta domain protein region  30 
 
 		 109 aa  50.8  0.000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1589  DNA polymerase beta domain protein region  34.43 
 
 		 96 aa  46.2  0.0001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2535  DNA polymerase, beta-like region  31.71 
 
 		 116 aa  44.7  0.0004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000686331  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2848  hypothetical protein  34.29 
 
 		 108 aa  44.7  0.0005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3599  DNA polymerase beta domain protein region  30.56 
 
 		 102 aa  43.5  0.0009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000413662  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5818  DNA polymerase beta domain protein region  25.81 
 
 		 96 aa  43.5  0.0009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3743  DNA polymerase beta domain protein region  35.71 
 
 		 98 aa  43.1  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1102  hypothetical protein  35.14 
 
 		 100 aa  43.1  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.836571  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0270  nucleotidyltransferase domain-containing protein  43.33 
 
 		 135 aa  42.7  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.440685  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0547  DNA polymerase beta subunit  37.66 
 
 		 100 aa  42  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.790238  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3676  DNA polymerase beta domain protein region  34.21 
 
 		 132 aa  41.6  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.839378  normal  0.137366 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0491  hypothetical protein  29.17 
 
 		 112 aa  41.6  0.004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.484621  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1736  hypothetical protein  38.46 
 
 		 271 aa  41.2  0.004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.76389  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1619  DNA polymerase beta domain-containing protein region  34.72 
 
 		 105 aa  41.2  0.005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.316623  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2655  DNA polymerase beta subunit  33.33 
 
 		 108 aa  40.8  0.006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.748854  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5631  DNA polymerase beta domain protein region  46.51 
 
 		 102 aa  40.8  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000350885  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3962  DNA polymerase beta domain protein region  37.66 
 
 		 105 aa  40.8  0.006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1772  DNA polymerase beta domain protein region  27.42 
 
 		 99 aa  40  0.01  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>