24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_2535 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_2535  DNA polymerase, beta-like region  100 
 
 		 116 aa  239  6e-63  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000686331  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0551  DNA polymerase beta domain protein region  41.9 
 
 		 106 aa  86.7  1e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3599  DNA polymerase beta domain protein region  41.03 
 
 		 102 aa  60.5  0.000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000413662  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0268  DNA polymerase beta domain protein region  40.32 
 
 		 100 aa  57.8  0.00000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1589  DNA polymerase beta domain protein region  36.67 
 
 		 96 aa  55.8  0.0000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1735  DNA polymerase beta domain protein region  35.62 
 
 		 106 aa  53.9  0.0000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3505  DNA polymerase beta subunit  37.18 
 
 		 115 aa  53.5  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3353  DNA polymerase beta subunit  35.42 
 
 		 112 aa  52  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1772  DNA polymerase beta domain protein region  37.93 
 
 		 99 aa  52.8  0.000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3592  DNA polymerase beta domain protein region  33.73 
 
 		 96 aa  50.4  0.000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000372185  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1570  DNA polymerase beta domain protein region  30.59 
 
 		 102 aa  48.9  0.00002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3010  restriction modification system DNA specificity subunit  37.1 
 
 		 549 aa  48.5  0.00003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.340841  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0131  DNA polymerase beta domain protein region  41.46 
 
 		 112 aa  47.8  0.00005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0221  hypothetical protein  30 
 
 		 112 aa  47.4  0.00007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0417  DNA polymerase beta domain protein region  33.33 
 
 		 109 aa  45.8  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1021  nucleotidyltransferase  27.27 
 
 		 99 aa  45.1  0.0004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.598559  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4035  DNA polymerase beta subunit  31.71 
 
 		 103 aa  44.7  0.0004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3165  hypothetical protein  39.44 
 
 		 139 aa  43.5  0.0008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0918  putative nucleotidyltransferase  26.14 
 
 		 99 aa  43.1  0.001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1760  DNA polymerase beta domain protein region  42.25 
 
 		 135 aa  42.7  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2086  DNA polymerase beta subunit  34.72 
 
 		 111 aa  42.7  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.166795  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0225  DNA polymerase beta domain protein region  31.68 
 
 		 142 aa  40.4  0.007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0806  nucleotidyltransferase substrate binding protein, HI0074 family  42.11 
 
 		 247 aa  40.4  0.008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2935  DNA polymerase beta subunit  31.94 
 
 		 115 aa  40.4  0.008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>