14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_3599 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_3599  DNA polymerase beta domain protein region  100 
 
 		 102 aa  207  3e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000413662  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0551  DNA polymerase beta domain protein region  38.46 
 
 		 106 aa  75.1  0.0000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1589  DNA polymerase beta domain protein region  40.22 
 
 		 96 aa  63.5  0.0000000008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0131  DNA polymerase beta domain protein region  36.17 
 
 		 112 aa  62.4  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2535  DNA polymerase, beta-like region  41.03 
 
 		 116 aa  60.5  0.000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000686331  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0268  DNA polymerase beta domain protein region  38.89 
 
 		 100 aa  48.1  0.00004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3592  DNA polymerase beta domain protein region  29.03 
 
 		 96 aa  45.1  0.0004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000372185  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0417  DNA polymerase beta domain protein region  28.72 
 
 		 109 aa  43.9  0.0008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4035  DNA polymerase beta subunit  30.56 
 
 		 103 aa  43.5  0.0009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3010  restriction modification system DNA specificity subunit  32.43 
 
 		 549 aa  41.2  0.005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.340841  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1668  DNA polymerase beta domain protein region  34.52 
 
 		 146 aa  41.2  0.005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2935  DNA polymerase beta subunit  33.78 
 
 		 115 aa  40.8  0.006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0250  DNA polymerase beta subunit  30.11 
 
 		 137 aa  40.4  0.009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1075  DNA polymerase beta subunit  41.07 
 
 		 132 aa  40  0.01  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141135 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>