17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_1589 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_1589  DNA polymerase beta domain protein region  100 
 
 		 96 aa  194  4.0000000000000005e-49  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3599  DNA polymerase beta domain protein region  40.22 
 
 		 102 aa  63.5  0.0000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000413662  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2535  DNA polymerase, beta-like region  36.67 
 
 		 116 aa  55.8  0.0000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000686331  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0551  DNA polymerase beta domain protein region  32.22 
 
 		 106 aa  53.1  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4035  DNA polymerase beta subunit  34.43 
 
 		 103 aa  46.2  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0491  hypothetical protein  35.06 
 
 		 112 aa  46.2  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.484621  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0131  DNA polymerase beta domain protein region  38.46 
 
 		 112 aa  46.2  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1772  DNA polymerase beta domain protein region  36.62 
 
 		 99 aa  44.7  0.0005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1691  DNA polymerase beta domain protein region  37.84 
 
 		 95 aa  43.9  0.0008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0339005 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0221  hypothetical protein  31.43 
 
 		 112 aa  42.4  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0268  DNA polymerase beta domain protein region  38.03 
 
 		 100 aa  42  0.003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3505  DNA polymerase beta subunit  41.82 
 
 		 115 aa  42  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0178  DNA polymerase, beta-like region  40 
 
 		 163 aa  42  0.003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0107452  normal  0.933077 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0893  DNA polymerase beta domain-containing protein region  30.69 
 
 		 143 aa  41.2  0.004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0417  DNA polymerase beta domain protein region  32.26 
 
 		 109 aa  40.8  0.006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2195  DNA polymerase beta domain protein region  54.76 
 
 		 145 aa  40.4  0.007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000295232  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3010  restriction modification system DNA specificity subunit  43.4 
 
 		 549 aa  40.4  0.008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.340841  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>