16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_0131 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_0131  DNA polymerase beta domain protein region  100 
 
 		 112 aa  234  2e-61  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3599  DNA polymerase beta domain protein region  36.17 
 
 		 102 aa  62.4  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000413662  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0551  DNA polymerase beta domain protein region  34.23 
 
 		 106 aa  52.8  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2535  DNA polymerase, beta-like region  41.46 
 
 		 116 aa  47.8  0.00005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000686331  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1589  DNA polymerase beta domain protein region  38.46 
 
 		 96 aa  46.2  0.0002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0491  hypothetical protein  50 
 
 		 112 aa  44.3  0.0006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.484621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0095  DNA polymerase beta subunit  41.18 
 
 		 112 aa  43.9  0.0008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.365343 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0250  DNA polymerase beta subunit  42.86 
 
 		 137 aa  43.1  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0825  DNA polymerase beta subunit  37.18 
 
 		 140 aa  42.4  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.453012  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1133  DNA polymerase beta subunit  38.46 
 
 		 123 aa  42  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1735  DNA polymerase beta domain protein region  32.18 
 
 		 106 aa  42  0.003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1207  DNA polymerase beta subunit  33.78 
 
 		 105 aa  41.6  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.901472  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0221  hypothetical protein  28.57 
 
 		 112 aa  41.2  0.005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5240  DNA polymerase beta domain protein region  41.51 
 
 		 104 aa  40.8  0.006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1570  DNA polymerase beta domain protein region  30.86 
 
 		 102 aa  40  0.009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0268  DNA polymerase beta domain protein region  27.63 
 
 		 100 aa  40.4  0.009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>